霉菌性食管炎有典型症状和其他症状，典型症状包括吞咽困难（食管黏膜受感染致管腔狭窄影响食物通过，免疫低下者症状更明显）和胸骨后疼痛（食管黏膜炎症刺激神经末梢，不同人群疼痛程度有差异）；其他症状有反酸、烧心（食管下括约肌功能受影响致胃酸反流）、呕吐（病情严重时食管黏膜受损致呕吐带血，儿童患者需关注营养及防脱水电解质紊乱）、体重减轻（进食量减少致体重降，不同年龄人群表现不同）、口腔异味（霉菌在口腔滋生产生异味，免疫力低人群易出现）。
吞咽困难：是霉菌性食管炎较为常见的典型症状，患者在进食固体或液体食物时会感到吞咽不畅，这是因为食管黏膜受到霉菌感染后，局部出现炎症、水肿，导致食管管腔狭窄，从而影响食物的通过。例如，一些患者可能最初只是觉得吃馒头等较干的食物时有阻碍感，随着病情发展，可能连喝水都会觉得吞咽困难。这种症状在不同年龄、性别、生活方式及病史的人群中都可能出现，对于本身存在免疫功能低下情况（如长期使用免疫抑制剂、患有艾滋病等）的人群，由于其自身抵抗力差，霉菌感染更容易导致严重的食管黏膜损伤，吞咽困难的症状可能会更明显且进展更快。
胸骨后疼痛：疼痛性质多为烧灼样、隐痛或刺痛等。这是由于食管黏膜炎症刺激神经末梢引起的。不同人群感受疼痛的程度可能有所差异，一般来说，年轻体健者可能对疼痛的耐受相对较好，但如果本身合并有其他基础疾病，如冠心病等，可能会干扰对胸骨后疼痛病因的判断。例如，一位患有霉菌性食管炎的老年患者，同时合并冠心病，那么其胸骨后疼痛可能需要与心绞痛等进行鉴别，此时就需要通过进一步的检查来明确病因。
其他症状
反酸、烧心：这是由于食管下括约肌功能受到影响，胃酸反流至食管引起的。霉菌感染导致食管黏膜受损，使食管下括约肌的正常功能发生紊乱，从而出现反酸、烧心症状。对于有不良生活方式的人群，如长期吸烟、饮酒、暴饮暴食等，更容易出现反酸、烧心症状加重的情况。比如，一位长期饮酒的霉菌性食管炎患者，饮酒后可能会刺激胃酸分泌增加，进而加重反酸、烧心的程度。
呕吐：病情较严重时可能出现呕吐症状，呕吐物可能为胃内容物，有时可能带有少量血液，这是因为食管黏膜充血、水肿、糜烂甚至溃疡，导致呕吐时损伤局部黏膜引起出血。对于儿童患者，霉菌性食管炎相对较少见，但如果发生，呕吐症状可能会对其营养状况产生较大影响，需要特别关注。儿童患者出现呕吐时，要注意及时补充水分和电解质，防止脱水和电解质紊乱，同时积极查找引起霉菌性食管炎的原因，如是否存在免疫功能低下等情况。
体重减轻：由于吞咽困难导致进食量减少，长期如此会引起体重减轻。不同年龄阶段的人群表现有所不同，儿童处于生长发育阶段，体重减轻可能会影响身高、智力等发育；成年人则可能出现体力下降、精神萎靡等情况。例如，一位患有霉菌性食管炎的成年患者，因为吞咽困难导致进食量比平时减少一半以上，经过一段时间后，体重明显下降，同时伴有易疲劳等表现。
口腔异味：霉菌在口腔内滋生可能会导致口腔出现异味，这是因为霉菌代谢产物等会产生特殊气味。对于糖尿病患者等免疫力相对较低的人群，更容易出现口腔异味的情况，因为这类人群的免疫功能相对较弱，更易受到霉菌等病原体的侵袭。比如，一位合并糖尿病的霉菌性食管炎患者，除了有霉菌性食管炎的典型症状外，口腔异味较为明显，需要在控制血糖的基础上积极治疗霉菌性食管炎。
