功能性胃肠病病因复杂，涉及生物学、心理社会及其他等多方面因素。生物学因素包括胃肠动力异常、内脏感觉过敏、肠道菌群失调；心理社会因素有精神心理障碍、生活事件与压力；其他因素包含饮食因素、遗传因素，各因素相互作用引发功能性胃肠病。
一、生物学因素
（一）胃肠动力异常
胃肠动力紊乱是功能性胃肠病的重要发病机制之一。例如在功能性消化不良患者中，常存在胃排空延迟、胃十二指肠运动协调失常等情况。研究发现，胃电活动异常可能影响胃的收缩和排空功能，导致食物在胃内停留时间延长，引起腹胀、早饱等症状。这种动力异常在不同年龄人群中均可出现，儿童可能因神经系统发育不完善等因素影响胃肠动力，而老年人则可能与胃肠平滑肌功能减退等有关。
（二）内脏感觉过敏
患者的内脏感觉阈值降低，对正常的内脏感觉刺激过于敏感。比如在肠易激综合征患者中，肠道对扩张等刺激的感知异常增强，即使是正常量的肠内容物也能引起明显的腹痛等不适症状。这种内脏感觉过敏的机制可能与肠道感觉神经递质改变有关，如5-羟色胺等神经递质的异常调节，在不同性别上可能存在一定差异，女性可能因激素水平变化等因素影响内脏感觉的敏感性。
（三）肠道菌群失调
肠道菌群与胃肠道的功能密切相关。肠道菌群失调可影响肠道的屏障功能、免疫功能以及胃肠动力等。例如，某些有害菌增多或有益菌减少时，可能导致肠道炎症反应激活，进而影响胃肠功能，引发功能性胃肠病相关症状。不同年龄阶段的人群肠道菌群组成不同，婴儿肠道菌群处于建立和完善阶段，老年人肠道菌群多样性降低，都可能因菌群失调增加患功能性胃肠病的风险，且不同生活方式下肠道菌群也会有变化，如长期高脂、高糖饮食可能破坏肠道菌群平衡。
二、心理社会因素
（一）精神心理障碍
长期的精神紧张、焦虑、抑郁等情绪问题与功能性胃肠病的发生发展密切相关。研究表明，约有一半以上的功能性胃肠病患者存在不同程度的精神心理障碍。例如，抑郁症患者更容易出现功能性消化不良或肠易激综合征的症状，这是因为不良情绪可通过神经-内分泌-免疫调节网络影响胃肠道的功能。不同性别中，女性可能相对更容易受情绪因素影响，因为女性的生理特点使其在面对压力时情绪调节机制可能相对更脆弱，不同年龄人群中，青少年可能因学习压力等出现情绪问题进而影响胃肠功能，老年人可能因退休等生活变化产生情绪波动导致胃肠不适。
（二）生活事件与压力
生活中的重大事件、长期的工作压力等也会诱发功能性胃肠病。例如，经历亲人离世、失业等重大生活事件后，患功能性胃肠病的几率可能增加。长期处于高压力工作状态下的人群，如IT行业从业者等，由于持续的精神紧张，会影响胃肠道的正常功能，导致胃肠功能紊乱。不同生活方式的人群面临的压力源不同，如长期熬夜、缺乏运动的人群可能因生活方式不健康增加压力对胃肠的影响风险。
三、其他因素
（一）饮食因素
不合理的饮食结构可引发功能性胃肠病。例如，长期食用辛辣、油腻、刺激性食物，或过度饮酒、吸烟等，都可能刺激胃肠道黏膜，破坏胃肠道的正常生理功能。不同年龄人群的饮食特点不同，儿童如果过多食用零食、饮料等，可能影响正常的胃肠消化功能；老年人牙齿咀嚼功能下降，饮食过于精细也可能导致胃肠功能紊乱。不同性别在饮食偏好上可能有差异，女性可能相对更注重减肥等导致饮食不规律，进而影响胃肠健康。
（二）遗传因素
部分功能性胃肠病可能与遗传有关。研究发现，某些基因的多态性与功能性胃肠病的易感性相关。例如，某些与胃肠动力调节、肠道神经递质代谢等相关的基因变异可能增加个体患功能性胃肠病的风险。但遗传因素并不是单独起作用，而是与环境等因素相互作用，不同家族中可能因遗传背景不同，后代患功能性胃肠病的几率有所差异。
