慢性肾盂肾炎有全身表现、泌尿系统表现及其他表现。全身表现急性期有发热等，慢性期全身症状轻；泌尿系统表现有尿路刺激症状、腰痛、尿液异常；后期可出现肾功能损害表现，如夜尿增多、水肿、高血压等，不同人群表现有差异。
一、全身表现
急性期表现：部分患者可出现与急性肾盂肾炎类似的全身症状，如发热，体温可在38℃左右，也可更高，伴有寒战、乏力、食欲减退等，年龄较小的儿童可能表现为精神萎靡、哭闹不安等，这是因为儿童的机体反应与成人不同，免疫系统发育尚不完善，感染后全身症状相对更明显。
慢性期表现：全身症状相对较轻，可能仅有低热或无发热，容易被忽视，对于有基础疾病或免疫力低下的人群，如老年人、糖尿病患者等，慢性肾盂肾炎的全身表现可能更不典型，需特别留意。
二、泌尿系统表现
尿频、尿急、尿痛：这是比较常见的尿路刺激症状，与细菌感染刺激尿路黏膜有关。但在儿童中，可能表述不清晰，需要家长仔细观察孩子是否有频繁排尿、排尿时哭闹等表现。
腰痛：多为腰部隐痛或酸痛，疼痛程度不一，部分患者可出现肾区叩击痛。老年人由于机体敏感性下降，腰痛症状可能不明显，需要通过体格检查等辅助手段来判断。
尿液异常：可出现蛋白尿，一般为少量蛋白尿；镜下血尿，可见红细胞；还可能出现白细胞尿，甚至脓尿。对于糖尿病合并慢性肾盂肾炎的患者，尿液异常可能更易合并其他改变，需要综合判断。
三、其他表现
肾功能损害表现：在慢性肾盂肾炎后期，可出现肾功能减退的相关表现，如夜尿增多，这是因为肾小管浓缩功能受损，老年人随着年龄增长本身肾功能就有一定减退，合并慢性肾盂肾炎时夜尿增多的表现可能更突出；还可出现水肿，初期多为眼睑、颜面水肿，随着病情进展可出现下肢水肿等；严重时可出现高血压，这与肾功能受损导致水钠潴留、肾素-血管紧张素-醛固酮系统激活等因素有关。
