以下人群不适合接种宫颈癌疫苗：对疫苗成分过敏者；处于妊娠期的女性；正在发热的人群；患有急性严重发热性疾病者；对蛋白过敏且属于严重过敏体质者；有严重既往疫苗接种不良反应史者。
处于妊娠期的女性
妊娠期女性不适合接种宫颈癌疫苗。目前的临床研究数据表明，接种宫颈癌疫苗可能会对胎儿产生潜在的不良影响，虽然相关的致畸等严重不良事件发生概率较低，但为了最大程度保障胎儿的安全，妊娠期女性应避免接种宫颈癌疫苗。如果在接种疫苗期间发现怀孕，应暂停后续接种，待分娩后再继续完成接种程序。
正在发热的人群
当人体处于发热状态时，自身免疫系统处于相对应激的状态，此时接种宫颈癌疫苗可能会影响疫苗的免疫效果，同时也可能加重发热等不适症状，还可能增加接种疫苗后不良反应发生的风险。一般建议在发热症状消退，身体恢复健康后再考虑接种宫颈癌疫苗。
患有急性严重发热性疾病者
患有急性严重发热性疾病时，机体的生理状态较为特殊，接种宫颈癌疫苗可能无法达到预期的免疫应答效果，而且还可能干扰疾病的正常诊断和治疗，甚至可能导致疫苗相关不良反应的发生率升高。所以这类人群不适合立即接种宫颈癌疫苗，应等疾病痊愈后再评估是否可以接种。
对蛋白过敏且属于严重过敏体质者
除了对疫苗成分过敏外，若属于严重过敏体质，对蛋白过敏情况较为严重，接种宫颈癌疫苗后发生严重过敏反应的风险较高。因为宫颈癌疫苗的某些成分可能涉及蛋白质相关物质，严重过敏体质者接触后容易引发强烈的过敏反应，所以这类人群不适合接种宫颈癌疫苗。
有严重既往疫苗接种不良反应史者
如果既往接种其他疫苗时有过严重的不良反应史，如出现了难以控制的过敏反应、神经系统严重并发症等情况，那么接种宫颈癌疫苗时发生类似严重不良反应的风险也会增加，所以这类人群需要谨慎评估后再决定是否接种宫颈癌疫苗，通常不建议轻易接种。
