胎儿不发育可能由多种因素导致，包括染色体异常（父母双方染色体数目或结构异常、孕妇年龄大致卵子染色体不分离概率高）、母体因素（内分泌异常如黄体、甲状腺、糖尿病问题，子宫异常如畸形、肌瘤、粘连，感染病毒或寄生虫）、父亲因素（精子染色体异常）、环境因素（高辐射、有害化学物质、不良精神状态）。
母体因素
内分泌异常：如黄体功能不全，黄体分泌的孕激素对于维持妊娠至关重要，若黄体功能不足，孕激素分泌不足，就无法为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，从而可能引起胎儿不发育。甲状腺功能异常也会对胎儿发育产生影响，甲状腺激素参与胎儿的生长发育、神经系统发育等多个过程，甲状腺功能减退或亢进都可能干扰胎儿的正常发育。患有糖尿病的孕妇，如果血糖控制不佳，高血糖环境会影响胎盘的血流灌注和物质交换，进而影响胎儿发育，增加胎儿不发育的风险。
子宫异常：子宫畸形，如单角子宫、双角子宫等，会使子宫腔的形态异常，影响胚胎的着床和发育空间；子宫肌瘤，尤其是黏膜下子宫肌瘤，会改变宫腔内的环境，阻碍胚胎的正常生长；宫腔粘连也会限制胚胎的着床和发育，导致胎儿不发育。
感染因素：孕妇在孕期感染某些病毒，如风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等，这些病毒可以通过胎盘感染胎儿，影响胎儿的正常发育，导致胎儿不发育。孕妇感染弓形虫等寄生虫也可能对胎儿造成不良影响。
父亲因素
父亲的精子染色体异常也可能导致胎儿不发育。男性精子的质量受到多种因素影响，如长期接触放射性物质、化学毒物、高温环境等，都可能引起精子染色体的畸变，当这样的精子与卵子结合形成胚胎后，就容易出现胎儿不发育的情况。
环境因素
孕妇长期处于高辐射环境中，如接触X射线等，辐射可能会导致胎儿细胞的DNA受损，影响胎儿的正常发育；孕妇长期接触某些有害化学物质，如苯、甲醛等，这些化学物质可能通过胎盘进入胎儿体内，干扰胎儿的正常发育过程，增加胎儿不发育的风险。此外，孕妇长期处于紧张、焦虑等不良精神状态下，也可能通过神经内分泌系统影响胎儿的发育，导致胎儿不发育。
