胎儿室间隔缺损的发生与遗传因素、环境因素及其他因素有关。遗传方面有家族史及相关基因突变影响；环境因素包括母体感染风疹病毒、不合理用药、接触有害化学物质、放射线暴露；其他因素有孕期糖尿病、营养缺乏如叶酸不足等。
环境因素
母体感染：母亲在妊娠早期如果感染了某些病毒，如风疹病毒等，病毒可以通过胎盘影响胎儿心脏的发育。风疹病毒感染可能干扰心脏胚胎的正常分化和融合过程，使得室间隔在发育过程中出现异常，进而引发室间隔缺损。例如，孕妇在怀孕前3个月内感染风疹病毒，胎儿患先天性心脏病包括室间隔缺损的概率会显著升高。
药物影响：孕妇在妊娠期不合理使用某些药物也可能增加胎儿室间隔缺损的风险。一些特定的药物可能会干扰胎儿的心血管系统发育，例如某些抗肿瘤药物、抗癫痫药物等。这些药物可能通过影响胎儿细胞的分裂、分化等过程，导致心脏结构发育异常，其中就包括室间隔缺损。
化学物质接触：如果孕妇在孕期接触了过多的有害化学物质，如某些工业污染物等，也可能对胎儿心脏发育产生不良影响。这些化学物质可能通过改变胎儿体内的代谢环境或直接作用于心脏发育相关的细胞和组织，干扰室间隔的正常形成，从而引发室间隔缺损。
放射线暴露：孕妇在妊娠期受到过量的放射线照射，如接受腹部X线检查等，放射线可能会损伤胎儿的遗传物质和正在发育的心脏组织，影响心脏的正常发育过程，增加室间隔缺损等先天性心脏病的发生风险。
其他因素
孕期糖尿病：孕妇如果患有糖尿病且血糖控制不佳，高血糖环境可能会影响胎儿的心血管系统发育。高血糖可以通过多种途径干扰胎儿心脏的正常构建，例如影响胚胎细胞的能量代谢、改变细胞外基质成分等，进而增加胎儿发生室间隔缺损的可能性。
营养因素：孕妇在孕期如果缺乏某些重要的营养物质，如叶酸等，也可能与胎儿室间隔缺损的发生有关。叶酸对于细胞的分裂和DNA合成等过程非常重要，缺乏叶酸可能导致胎儿心脏发育过程中出现缺陷，包括室间隔缺损。例如，孕妇叶酸摄入不足时，胎儿神经管和心脏等器官的发育可能受到影响，增加先天性心脏病的发生风险。
