卵巢畸胎瘤的发生与遗传因素、生殖细胞异常、内分泌因素、胚胎期发育异常、免疫因素等有关，遗传因素使部分卵巢畸胎瘤具遗传倾向；原始生殖细胞异常分化致其形成；内分泌失衡可能影响卵巢正常功能；胚胎早期发育受不利因素影响致生殖细胞异位生长可引发；机体免疫状态异常时可能无法清除异常增殖细胞而致其发病。
一、遗传因素
部分卵巢畸胎瘤具有一定的遗传倾向。某些遗传综合征可能增加卵巢畸胎瘤的发病风险，例如皮-杰综合征（Peutz-Jegherssyndrome）等，这类综合征与特定的基因变异相关，基因的异常可能影响卵巢组织的正常发育和分化，从而导致畸胎瘤的发生。
二、生殖细胞异常
原始生殖细胞的异常分化是卵巢畸胎瘤发生的重要原因之一。在胚胎发育过程中，原始生殖细胞具有向多种组织细胞分化的潜能，如果原始生殖细胞在迁移和分化过程中出现异常，就可能形成含有多种组织成分的畸胎瘤。正常情况下原始生殖细胞会有序地分化为成熟的生殖细胞，但在某些因素影响下，其分化过程发生紊乱，导致形成包含外胚层、中胚层、内胚层等多种组织成分的畸胎瘤。
三、内分泌因素
内分泌失衡可能与卵巢畸胎瘤的发生有关。女性体内的雌激素、孕激素等激素水平对卵巢的正常功能起着重要调节作用。当内分泌系统出现紊乱时，可能影响卵巢的正常生理过程。例如，长期的雌激素水平异常升高，可能干扰卵巢生殖细胞的正常发育，为畸胎瘤的形成创造条件。有研究发现，在一些卵巢畸胎瘤患者体内，激素水平的波动与正常女性存在差异，这种差异可能与畸胎瘤的发生发展相关。
四、胚胎期发育异常
在胚胎早期发育阶段，如果受到某些不利因素影响，可能导致生殖细胞异位生长。例如，部分生殖细胞可能没有迁移到正常的卵巢位置，而是停留在其他部位并异常分化，最终形成卵巢畸胎瘤。这种胚胎期的发育异常是先天性的因素之一，虽然具体的诱发胚胎期发育异常的因素尚不十分明确，但已知一些外界不良因素，如母体在孕期接触某些有害物质（如化学毒物、辐射等），可能增加胚胎期发育异常的风险，进而提高卵巢畸胎瘤的发病几率。
五、免疫因素
机体的免疫状态也可能与卵巢畸胎瘤的发生相关。当免疫系统出现异常时，可能无法正常识别和清除异常增殖的细胞。如果卵巢组织中的细胞出现异常增殖倾向，而免疫系统不能有效地发挥监视和清除作用，就可能使得这些异常细胞逐渐发展为畸胎瘤。例如，一些自身免疫性疾病患者，由于免疫系统功能紊乱，其患卵巢畸胎瘤的风险可能相对较高。
