小儿心肌炎的引发因素包括病毒感染（肠道病毒、呼吸道病毒等）、细菌感染（链球菌感染）、其他病原体感染（支原体感染）、自身免疫因素、药物和毒素因素以及个体因素（年龄、基础疾病、生活方式）。
呼吸道病毒：如流感病毒、腺病毒等也可引起小儿心肌炎。流感病毒感染后，病毒可在呼吸道黏膜细胞中复制，然后通过血液循环到达心肌，导致心肌炎症。有研究表明，在流感流行季节，小儿患心肌炎的风险会有所增加，其中部分患儿是由流感病毒感染引发。
细菌感染
链球菌感染：A组β溶血性链球菌感染后可引起风湿热，而风湿热是导致小儿风湿性心肌炎的重要原因。链球菌感染人体后，机体产生免疫反应，形成的抗原抗体复合物可沉积在心肌等组织中，引发炎症。据统计，在风湿性心肌炎患儿中，有相当一部分是由A组β溶血性链球菌感染诱发。
其他病原体感染
支原体感染：肺炎支原体感染也可能与小儿心肌炎有关。肺炎支原体感染后，其释放的毒素等物质可影响心肌细胞的正常功能，导致心肌炎症。研究发现，部分小儿心肌炎患儿在发病前有支原体感染的病史，且通过检测支原体抗体等可辅助诊断。
自身免疫因素
当小儿自身免疫功能紊乱时，机体的免疫系统可能错误地将心肌细胞当作外来异物进行攻击，从而引发心肌炎。例如一些患有自身免疫性疾病的小儿，如系统性红斑狼疮等，其发生心肌炎的概率相对较高，因为自身免疫性疾病会导致免疫系统失调，攻击心肌组织。
药物和毒素因素
药物：某些小儿使用的药物可能对心肌有损害作用，从而诱发心肌炎。例如一些抗肿瘤药物、某些抗生素等，但相对来说这种情况在小儿中相对较少见，但仍需引起重视。
毒素：小儿接触某些毒素也可能导致心肌炎，如白喉杆菌产生的白喉毒素，可损害心肌细胞，引发心肌炎。在一些白喉流行地区，小儿患白喉性心肌炎的病例时有报道。
个体因素
年龄：小儿时期免疫系统等发育尚不完善，相对更容易受到各种病原体的侵袭，而且心肌等组织对病原体的反应也与成人有所不同，所以儿童尤其是婴幼儿患心肌炎的风险相对较高。
基础疾病：如果小儿本身患有先天性心脏病等基础疾病，那么其发生心肌炎的风险可能会增加。因为基础疾病会影响心脏的正常结构和功能，使得心肌在受到病原体等因素影响时更容易发生炎症反应。
生活方式：儿童如果生活在卫生条件较差的环境中，感染病原体的机会增加，从而增加了患心肌炎的风险；而如果小儿过度疲劳、营养不良等，也会影响机体的免疫力，使身体更易受到病原体侵袭，进而诱发心肌炎。
