习惯性流产的发生与多种因素相关，包括遗传因素如夫妇染色体异常；解剖因素如子宫畸形、宫腔粘连；内分泌因素如黄体功能不全、甲状腺功能异常；感染因素如生殖道细菌、病毒感染；免疫因素如自身免疫性疾病、同种免疫异常等，各因素在不同人群中有不同表现及影响。
解剖因素
子宫解剖结构异常
子宫畸形：如单角子宫、双角子宫、纵隔子宫等。子宫畸形会使子宫宫腔形态异常，影响胚胎的着床和发育环境。例如纵隔子宫，纵隔占据宫腔部分空间，导致宫腔有效容积减小，胚胎着床后空间受限，增加流产风险。这种情况在女性中较为常见，尤其是有先天性子宫发育异常病史的女性。
宫腔粘连：多因宫腔操作（如人工流产、刮宫等）、感染等原因引起。宫腔粘连会破坏子宫内膜的完整性和容受性，影响胚胎的种植和生长。任何有宫腔操作史的女性都可能发生宫腔粘连，从而增加习惯性流产的可能性。
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对于维持妊娠至关重要。黄体功能不全时，孕酮分泌不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，导致流产。育龄女性尤其是有月经不调病史、曾出现早期流产的女性，黄体功能不全的发生率相对较高。
甲状腺功能异常
甲状腺功能减退：甲状腺激素水平异常会影响胚胎的生长发育。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，可导致母体代谢率降低，影响胚胎的能量供应和发育进程，增加习惯性流产风险。各年龄段女性均可发生，尤其是有自身免疫性疾病（如桥本甲状腺炎）病史的女性更易出现甲状腺功能减退相关问题。
甲状腺功能亢进：严重的甲状腺功能亢进会使母体处于高代谢状态，影响胚胎的生长环境，也可能导致习惯性流产。育龄女性中甲状腺功能亢进患者若未得到良好控制，发生习惯性流产的风险增加。
感染因素
生殖道感染
细菌感染：如支原体、衣原体感染等。这些病原体可通过多种途径影响妊娠，如引起子宫内膜炎症，干扰胚胎着床和发育。任何有不洁性生活史或生殖道感染史的女性都可能受到影响，尤其在性生活活跃的育龄女性中较为常见。
病毒感染：如风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等。孕妇感染这些病毒后，可通过胎盘感染胎儿，导致胚胎发育异常、流产。孕前或孕期感染相关病毒的女性，发生习惯性流产的风险显著升高，不同年龄段女性均可能面临该风险，尤其是未接种相关疫苗且接触病毒风险较高的女性。
免疫因素
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮、抗磷脂综合征等。抗磷脂综合征患者体内存在抗磷脂抗体，可引起胎盘血管血栓形成，影响胎盘的血液供应，导致胚胎缺氧、发育受阻，进而引发流产。自身免疫性疾病好发于育龄女性，且病情活动期更易导致习惯性流产。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受失衡，导致母体免疫系统攻击胚胎，引发流产。这种情况在反复发生习惯性流产但无明显解剖、内分泌、感染等异常的夫妇中较为常见，免疫因素的影响在不同性别中均存在，但主要涉及母体的免疫状态。
