性腺功能异常所致精神障碍的病因包括性激素水平异常相关因素（如男女性腺功能减退致相应激素分泌减少影响神经递质代谢引发精神障碍）、内分泌系统整体调节失衡（打破HPG轴反馈调节机制并影响其他内分泌激素致神经精神系统功能受扰）、个体神经生物学基础差异（大脑神经结构和递质系统差异致对性激素变化敏感性不同表现不同精神症状）、生活方式与病史影响（长期不良生活方式加重影响及既往有内分泌疾病史者更易出现相关精神障碍）。
一、性激素水平异常相关因素
性腺功能减退：
男性：睾丸功能减退时，雄激素分泌减少。例如克氏综合征患者，其染色体核型多为47，XXY，睾丸发育不全，雄激素产生不足。研究表明，雄激素对维持男性的情绪、认知等心理功能有重要作用，雄激素水平降低可影响大脑神经递质的代谢等，进而引发精神障碍。
女性：卵巢功能异常，如卵巢早衰，雌激素和孕激素分泌减少。卵巢早衰可发生于不同年龄阶段，青年女性若出现卵巢早衰，雌激素水平急剧下降，会影响神经内分泌调节，导致5-羟色胺、多巴胺等神经递质代谢紊乱，从而增加精神障碍发生的风险。
二、内分泌系统整体调节失衡
性腺功能与下丘脑-垂体-性腺轴（HPG轴）密切相关。当性腺功能异常时，会打破HPG轴的正常反馈调节机制。下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）减少或增多，会影响垂体分泌促性腺激素（如促卵泡生成素FSH、促黄体生成素LH），进而影响性腺的功能。同时，这种内分泌系统的失衡还可能影响其他内分泌激素的分泌，如甲状腺激素等，间接干扰神经精神系统的功能。例如，性腺功能异常可能导致甲状腺-垂体-下丘脑轴的功能紊乱，进而出现情绪、认知等方面的异常表现。
三、个体的神经生物学基础差异
不同个体的大脑神经结构和神经递质系统存在差异。对于性腺功能异常的个体，其大脑中与情绪、认知等相关的脑区对性激素水平变化的敏感性不同。例如，部分人可能在雄激素水平轻度降低时，就会出现明显的抑郁、焦虑等精神症状，这与个体大脑中雄激素受体的数量、分布及敏感性有关。在女性中，雌激素受体的差异也可能导致不同个体对卵巢功能异常引起的激素变化产生不同的精神反应，有的女性可能表现为情绪低落、记忆力减退等，而有的女性可能出现烦躁不安、失眠等症状。
四、生活方式与病史影响
生活方式：长期不良的生活方式，如缺乏运动、过度吸烟饮酒等，可能会加重性腺功能异常对精神的影响。例如，吸烟可能影响性激素的代谢，饮酒会干扰肝脏对激素的代谢过程，从而进一步破坏内分泌平衡，增加精神障碍发生的可能性。
病史：既往有内分泌疾病史的患者，如甲状腺疾病、肾上腺疾病等，更容易出现性腺功能异常相关的精神障碍。因为这些疾病本身就会影响内分泌系统的整体功能，当合并性腺功能异常时，神经精神系统受到的影响更为复杂。例如，患有甲状腺功能减退的患者，同时出现性腺功能减退，两者相互作用，会使精神症状更加严重，如出现严重的抑郁、认知功能下降等表现。
