丘脑下部损伤会引发多种功能紊乱，包括体温调节障碍，致体温显著波动，儿童更易体温不稳定；水盐代谢紊乱，抗利尿激素分泌异常可致尿崩症或水钠潴留、低钠血症等；内分泌功能紊乱，促垂体激素和生长激素分泌异常影响相关激素及生长发育等；睡眠-觉醒周期紊乱，致睡眠障碍影响儿童生长发育和成人生活工作；自主神经功能失调，致心血管、消化等系统功能异常，影响儿童相关发育及成人健康。
表现：可出现体温的显著波动，对于儿童来说，由于其体温调节中枢发育尚未完善，丘脑下部损伤后更容易出现体温不稳定，可能表现为高热或低温。成人也可能出现体温异常，如高热时体温可超过39℃，低温时可低于36℃。
水盐代谢紊乱
机制：丘脑下部的某些核团与水盐代谢的调节有关，例如视上核和室旁核分泌抗利尿激素（ADH），调节肾脏对水的重吸收；同时还参与钠、钾等电解质的调节。丘脑下部损伤后，抗利尿激素分泌异常，会导致水盐代谢紊乱。
表现：若抗利尿激素分泌减少，可引起尿崩症，表现为多尿，24小时尿量可多达5-10升甚至更多，儿童尿崩时会出现频繁排尿、口渴、大量饮水等情况。若水钠潴留，可出现水肿、血钠升高等表现；若失钠过多，可出现低钠血症，表现为乏力、恶心、呕吐、精神萎靡等，儿童低钠时可能影响其神经系统发育和功能，导致智力、运动等方面的问题。
内分泌功能紊乱
促垂体激素分泌异常
机制：丘脑下部分泌促垂体激素释放激素和释放抑制激素来调节垂体前叶各种激素的分泌。丘脑下部损伤后，这些促垂体激素的分泌失衡。
表现：例如促甲状腺激素释放激素分泌减少，可导致促甲状腺激素及甲状腺激素分泌减少，儿童会出现生长发育迟缓、智力低下等；促性腺激素释放激素分泌异常可影响性腺的发育和功能，青春期前儿童可出现性发育迟缓，成人则可出现月经紊乱、性功能障碍等。
生长激素分泌异常
机制：丘脑下部的生长激素释放激素（GHRH）和生长激素释放抑制激素（GHRIH）调节生长激素的分泌，丘脑下部损伤后影响其平衡。
表现：儿童生长激素分泌异常可严重影响身高发育，导致身材矮小；成人可能出现代谢紊乱等情况。
睡眠-觉醒周期紊乱
机制：丘脑下部与睡眠-觉醒周期的调节有关，其内部的一些神经结构参与调控昼夜节律。
表现：患者可出现睡眠障碍，如失眠、嗜睡等。儿童睡眠周期紊乱可能影响其生长激素的分泌和正常的生长发育，还可能导致注意力不集中、学习能力下降等。成人则可能影响日常生活和工作效率，长期睡眠觉醒周期紊乱还可能引发心血管等系统的并发症。
自主神经功能失调
机制：丘脑下部是自主神经的高级中枢，调节内脏活动，包括心血管、消化等系统的自主神经功能。
表现：心血管系统方面可出现血压波动，儿童血压不稳定可能影响其心血管发育；消化系统可出现食欲异常，如食欲减退或亢进，儿童食欲异常会影响营养摄入，进而影响生长发育；还可能出现多汗或无汗等汗腺分泌异常的情况，儿童汗腺发育与成人不同，丘脑下部损伤后多汗或无汗对儿童皮肤散热、保湿等功能影响较大，可能导致皮肤感染等问题。
