真菌性阴道炎主要由假丝酵母菌引起，常见病因有阴道内环境改变（雌激素水平变化、阴道pH值改变）、假丝酵母菌感染途径（内源性感染、外源性感染）、特殊人群因素（妊娠期女性、婴幼儿）。阴道内雌激素水平变化、pH值改变等致环境适宜假丝酵母菌繁殖，内源性是自身不同部位假丝酵母菌转移，外源性是接触污染衣物，妊娠期女性和婴幼儿因自身特点易发病。
阴道内环境改变
雌激素水平变化：女性在妊娠期间，体内雌激素水平升高，会使阴道上皮细胞内糖原含量增加，阴道酸度升高，有利于假丝酵母菌生长繁殖。另外，长期应用广谱抗生素、大量应用免疫抑制剂或患有糖尿病等，也会改变阴道内环境，导致假丝酵母菌大量繁殖引发炎症。例如，糖尿病患者血糖控制不佳时，阴道局部糖原含量增高，pH值改变，为假丝酵母菌生长提供了适宜条件。
阴道pH值改变：正常阴道pH值在3.8-4.4之间，当阴道pH值发生变化时，假丝酵母菌容易大量繁殖。如长期使用碱性溶液冲洗阴道，会破坏阴道正常的酸性环境，使pH值升高，从而增加真菌性阴道炎的发病风险。
假丝酵母菌感染途径
内源性感染：假丝酵母菌除了是阴道的条件致病菌外，还可寄生于人的口腔、肠道，这三个部位的假丝酵母菌可相互传染。当局部环境条件适宜时，比如上述阴道内环境改变的情况，寄生在肠道或口腔的假丝酵母菌就可能转移到阴道引发感染。
外源性感染：少部分患者可通过接触感染假丝酵母菌的衣物而被传染。比如与患有真菌性阴道炎的患者共用毛巾、浴盆等物品，或者穿着被假丝酵母菌污染的内裤等，都有可能感染假丝酵母菌引发阴道炎。
特殊人群因素
妊娠期女性：妊娠期女性由于体内激素水平变化，如前所述雌激素升高，阴道局部免疫力下降，更容易受到假丝酵母菌的侵袭，患真菌性阴道炎的风险增加。
婴幼儿：婴幼儿雌激素水平低，阴道上皮薄，糖原少，pH值偏高，局部抵抗力低，也可能因接触被污染的衣物等而感染假丝酵母菌引发阴道炎。例如，婴幼儿使用被假丝酵母菌污染的尿布等，就可能导致发病。
