细菌性阴道炎发病与阴道菌群失调、性生活因素、卫生习惯不良、年龄因素及其他因素（长期用抗生素、免疫低下等）相关，阴道菌群失调时乳杆菌减少、致病菌增多，性生活频繁等致微生态改变，不良卫生习惯破坏菌群平衡，育龄期女性因环境活跃易患，长期用抗生素等会增加风险。
阴道菌群失调：正常阴道内以产生过氧化氢的乳杆菌占优势，而细菌性阴道炎患者阴道内乳杆菌减少，加德纳菌、厌氧菌等增多，阴道菌群平衡被打破。例如，多项研究发现，细菌性阴道炎患者阴道中乳杆菌的数量显著低于健康女性，而加德纳菌等条件致病菌的数量明显升高。这是因为阴道内环境的改变，如pH值升高等，有利于这些致病菌的生长繁殖。
性生活因素：频繁的性生活、多个性伴侣等性生活相关因素可能增加细菌性阴道炎的发病风险。有研究表明，有多个性伴侣的女性患细菌性阴道炎的几率明显高于单一性伴侣者。这可能是由于性生活过程中会改变阴道的微生态环境，使阴道的防御机制受到影响，从而容易引发菌群失调导致发病。
卫生习惯不良：不注意外阴清洁、过度冲洗阴道等不良卫生习惯也与细菌性阴道炎的发生有关。过度冲洗阴道会破坏阴道原有的正常菌群平衡，导致阴道pH值改变，有利于致病菌的生长。例如，经常使用阴道洗液冲洗的女性，患细菌性阴道炎的概率比用清水清洗外阴的女性高。
年龄因素：育龄期女性相对更容易患细菌性阴道炎。这与育龄期女性阴道微生态环境相对活跃，且可能受到性生活、激素水平等多种因素影响有关。而绝经后女性由于雌激素水平降低，阴道黏膜变薄，局部抵抗力下降，也可能出现阴道菌群失调，但相对育龄期女性发病机制有所不同。
其他因素：长期使用抗生素、免疫功能低下等情况也可能增加细菌性阴道炎的发病风险。长期使用抗生素会抑制阴道内乳杆菌的生长，破坏阴道菌群平衡；免疫功能低下的人群，如患有糖尿病等基础疾病的女性，身体对病原菌的抵御能力减弱，更容易发生细菌性阴道炎。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，阴道内糖原含量升高，pH值改变，有利于念珠菌等致病菌生长，同时也为细菌性阴道炎的致病菌创造了适宜的生长环境。
