霉菌性龟头炎治疗包括一般治疗、药物治疗及性伴侣处理。一般治疗需保持局部清洁卫生、避免刺激；药物治疗有外用抗真菌药（如克霉唑、咪康唑乳膏）和口服抗真菌药（如氟康唑，需考虑患者情况）；若由性传播引起，性伴侣需同时检查治疗以防交叉感染。
一、一般治疗
1.保持局部清洁卫生
对于不同年龄、性别的患者，都应每日用清水清洗龟头和包皮，清除污垢，避免霉菌滋生。例如成年男性若有包皮过长的情况，更要仔细清洗包皮内板与龟头之间的污垢；儿童患者也要注意保持外生殖器的清洁，防止尿液残留等导致局部环境潮湿，利于霉菌生长。保持局部清洁卫生可以破坏霉菌生长的湿润环境，是基础的治疗措施。
2.避免刺激
无论是何种人群，都应避免搔抓、摩擦龟头，避免使用刺激性强的肥皂、清洁剂等。比如一些男性可能有不良的卫生习惯，使用刺激性强的洗浴用品，这会加重龟头的炎症反应，所以要避免此类情况。避免刺激能减少对龟头黏膜的损伤，防止炎症进一步加重。
二、药物治疗
1.抗真菌药物
外用抗真菌药物：对于大多数霉菌性龟头炎患者，外用抗真菌药物是常用的治疗方法。例如克霉唑乳膏，它可以通过抑制真菌细胞膜的合成来发挥抗真菌作用。适用于各年龄段患者，但儿童使用时需谨慎，应在医生指导下使用，因为儿童皮肤较为娇嫩，要注意药物的浓度和使用方法。咪康唑乳膏也是常用的外用抗真菌药，能有效抑制霉菌生长。
口服抗真菌药物：在一些病情较为严重、外用药物效果不佳或反复发作的情况下，可能会使用口服抗真菌药物，如氟康唑等。但口服药物需要考虑患者的年龄、肝肾功能等情况，儿童一般不优先选择口服抗真菌药物，因为儿童肝肾功能发育尚未完全成熟，药物代谢可能会受到影响。成人使用口服抗真菌药物时也需要监测肝肾功能等指标，确保用药安全。
三、性伴侣的处理
如果霉菌性龟头炎是由性传播引起的，性伴侣也需要同时进行检查和治疗。因为霉菌可以在性伴侣之间传播，无论是男性患者还是女性患者，其性伴侣都可能携带霉菌而没有明显症状。所以性伴侣需要进行相关检查，如有感染也需接受相应的抗真菌治疗，以避免交叉感染，防止霉菌性龟头炎反复发作。例如女性可能会感染霉菌性阴道炎而自己未察觉，通过性接触又会传染给男性患者，所以性伴侣的处理是霉菌性龟头炎治疗中很重要的一环。
