儿童遗尿症的发生与遗传因素、睡眠觉醒障碍、膀胱功能异常、抗利尿激素分泌异常、心理因素、发育迟缓等多种因素有关，遗传使孩子患遗尿症概率升高，睡眠觉醒障碍致不能及时醒而排尿，膀胱容量小、逼尿肌不稳定影响排尿，抗利尿激素分泌不足使夜间尿液多，心理压力会致神经功能紊乱引发遗尿，发育迟缓如脊柱畸形等也会导致遗尿。
睡眠觉醒障碍
儿童在睡眠过程中，对膀胱充盈的觉醒反应存在异常。正常情况下，当膀胱内尿液达到一定量时，会刺激膀胱壁的感受器，产生神经冲动传导至大脑皮层，使儿童觉醒并产生排尿意识。但患有遗尿症的儿童，这种睡眠觉醒障碍较为常见，他们在深度睡眠状态时，难以被膀胱的充盈刺激唤醒，导致不能及时醒来排尿，进而发生遗尿。一般来说，随着年龄增长，部分儿童的睡眠觉醒障碍会逐渐改善，但也有一些儿童会持续存在该问题。
膀胱功能异常
膀胱容量小：一些遗尿症儿童的膀胱容量比正常儿童小，这使得膀胱不能储存足够的尿液，容易在较短时间内就产生排尿冲动。通过超声等检查可以发现，遗尿症儿童的膀胱容量低于正常同龄儿童的平均水平。
膀胱逼尿肌不稳定：膀胱逼尿肌存在不自主收缩的情况，这会导致膀胱过早产生收缩，提前引发排尿感觉，而此时儿童可能还在深度睡眠中，无法及时做出排尿反应。相关的尿动力学检查可以检测到膀胱逼尿肌的这种异常收缩情况。
抗利尿激素分泌异常
人体中抗利尿激素（ADH）具有调节尿液浓缩的作用。正常情况下，夜间体内ADH分泌增加，会使尿液浓缩，减少尿液生成。而遗尿症儿童往往存在夜间ADH分泌不足的情况，导致夜间尿液生成量增多，超过了膀胱的容量，从而引发遗尿。研究发现，约30%-40%的遗尿症儿童存在夜间ADH分泌相对不足的现象。
心理因素
儿童的心理状态对遗尿症的发生也有一定影响。例如，家庭环境突然变化（如父母离异、新成员加入等）、孩子在学校面临较大的学习压力、受到过度的批评或惊吓等，都可能导致儿童出现心理应激反应，进而影响神经系统对膀胱的控制，引发遗尿。长期的心理压力会使儿童的神经功能紊乱，加重遗尿症状。
发育迟缓
在儿童生长发育过程中，如果存在神经系统发育迟缓、脊柱发育异常等情况，也可能导致遗尿症的发生。比如，脊柱裂等脊柱发育畸形的儿童，由于神经传导受到影响，对膀胱的控制能力下降，容易出现遗尿。一般来说，对于存在发育迟缓情况的儿童，需要密切关注其身体各系统的发育状况，及时发现并处理可能存在的问题。
