畸胎瘤成因包括生殖细胞异常分化和性腺或胚胎剩余组织异常，生殖细胞异常分化有胚胎期因素及基因层面影响，性腺或胚胎剩余组织异常包括性腺部位及胚胎其他部位剩余组织异常情况。
胚胎期因素：在胚胎发育早期，生殖细胞出现异常分化是导致畸胎瘤的重要原因。在正常胚胎发育过程中，生殖细胞会逐步迁移并分化形成各种成熟的组织细胞，但如果在这个过程中，部分生殖细胞脱离了正常的分化轨道，就有可能留存下来并逐渐形成畸胎瘤。从年龄角度来看，这种胚胎期就已存在的异常分化情况，在儿童及青少年群体中也可能发生，因为他们的身体仍处于生长发育阶段，胚胎发育相关的调控机制在这个时期若出现异常，就可能引发此类问题。
基因层面影响：某些基因的突变或异常表达也与畸胎瘤的发生密切相关。例如，一些涉及细胞分化、增殖调控的关键基因发生突变时，会干扰正常的细胞分化过程，增加畸胎瘤形成的风险。不同性别在基因层面对于畸胎瘤发生的易感性可能存在一定差异，但目前具体的基因相关机制仍在不断深入研究中。从生活方式角度，目前并没有直接证据表明特定的生活方式会直接导致基因层面的改变从而引发畸胎瘤，但长期的不良生活方式可能会影响身体的整体健康状态，间接对基因调控等产生一定影响。对于有家族遗传病史的人群，即有亲属曾患畸胎瘤且存在相关基因异常的情况，其发生畸胎瘤的风险相对较高，需要更加密切地进行健康监测。
性腺或胚胎剩余组织异常
性腺部位情况：在性腺组织中，如果胚胎剩余组织出现异常增生，就可能形成畸胎瘤。对于女性来说，卵巢部位是畸胎瘤较为常见的发生部位，胚胎剩余组织在卵巢内异常增殖，就会逐渐发展为卵巢畸胎瘤；男性的睾丸部位也可能出现类似情况，胚胎剩余组织异常增殖形成睾丸畸胎瘤。从年龄方面，不同年龄段都可能发生，但在儿童时期，睾丸或卵巢的畸胎瘤相对较为常见。在生活方式上，一般没有特定的生活方式会直接导致性腺部位胚胎剩余组织异常，但保持健康的生活方式对于维持性腺正常功能有一定帮助。对于有性腺相关疾病病史的人群，如曾有过性腺炎症等情况，可能会增加畸胎瘤的发生风险，需要及时就医进行相关检查和监测。
胚胎其他部位剩余组织：除了性腺部位，胚胎其他部位的剩余组织也可能形成畸胎瘤。例如，纵隔、骶尾部等部位都可能出现由胚胎剩余组织异常增殖形成的畸胎瘤。不同部位的畸胎瘤在症状表现和治疗方式上可能会有所不同，但都是由于胚胎剩余组织异常增殖所致。在年龄方面，各个年龄段都有可能发生在这些非性腺部位的畸胎瘤，对于婴幼儿时期发现的骶尾部畸胎瘤等情况，需要特别关注，因为婴幼儿的身体处于快速生长发育阶段，肿瘤的发展可能会对其生长发育产生较大影响，需要及时进行评估和处理。
