尿道结石有多种症状，疼痛方面有排尿痛（结石移动致尿道疼痛，排尿时加剧，不同年龄表现不同）及下腹部或会阴部疼痛（结石固定时出现，长时间站立等会加重）；排尿异常包括排尿困难（结石堵塞致尿线变细等，不同年龄表现有差异，有基础病史者更严重）、尿频尿急（结石刺激尿道黏膜引起，儿童及成年女性较易出现）；还有血尿（结石移动损伤黏膜致肉眼或镜下血尿，不同年龄表现不同，有基础疾病者需鉴别）；以及尿道分泌物（结石刺激致尿道腺体分泌增加，出现少量黏液性或脓性分泌物，不同年龄需与其他疾病鉴别）。
排尿痛：结石在尿道内移动时，会引起尿道的疼痛，疼痛程度不一，有的患者表现为刺痛，有的则是较为剧烈的疼痛，在排尿时疼痛往往会加剧。例如，前尿道结石患者在排尿时，疼痛会局限在结石部位，后尿道结石引起的疼痛可放射至会阴部或阴茎头部。不同年龄的患者对疼痛的感受可能有所不同，儿童可能会因为疼痛而出现哭闹、躁动等表现；成年患者则能较清晰地表述疼痛的部位和程度。对于有尿道结石病史的患者，再次发作时疼痛的感觉可能会更加敏锐。
下腹部或会阴部疼痛：当结石停留较固定时，可能会引起下腹部或会阴部的隐痛或胀痛。这种疼痛可能会持续存在，也可能间歇性发作。在生活方式方面，如果患者长时间站立、行走或进行剧烈运动，可能会导致疼痛加重。
排尿异常
排尿困难：结石堵塞尿道会导致排尿费力，尿液排出不畅，表现为尿线变细、射程变短等。严重时可能会出现尿滴沥，甚至无法排尿。不同年龄的患者排尿困难的表现有所差异，儿童可能会出现排尿时挣扎、用力等情况；成年男性由于尿道解剖结构的特点，结石引起的排尿困难可能更为明显。有前列腺增生等基础病史的患者，合并尿道结石时排尿困难的症状可能会更严重。
尿频、尿急：结石刺激尿道黏膜，可引起尿频、尿急的症状。患者会频繁地有尿意，但是每次尿量不多。在儿童中，由于尿道相对较短且黏膜较敏感，结石刺激更容易导致尿频、尿急的出现；成年女性尿道较短，也可能较容易出现这些症状。
血尿
肉眼血尿或镜下血尿：结石在尿道内移动时，会损伤尿道黏膜，导致黏膜出血，从而引起血尿。部分患者可以看到尿液呈红色，即为肉眼血尿；而有些患者需要通过尿常规检查才能发现红细胞，即镜下血尿。不同年龄的患者血尿的表现不同，儿童出现血尿时可能会被家长发现尿液颜色异常；成年患者如果本身对身体状况较为关注，可能会更早察觉血尿的情况。对于有泌尿系统基础疾病的患者，如肾小球肾炎等，合并尿道结石时血尿的表现可能会有所不同，需要仔细鉴别。
尿道分泌物
少量分泌物：结石刺激尿道黏膜，可导致尿道腺体分泌增加，出现少量的尿道分泌物。分泌物一般为黏液性或脓性。不同年龄的患者尿道分泌物的表现可能不同，儿童尿道结石引起的分泌物相对较少；成年男性如果有不洁性生活史等情况，需要与其他疾病引起的尿道分泌物进行鉴别。
