生殖器疱疹由单纯疱疹病毒感染经性接触传播等引起，症状有原发及复发时的生殖器水疱等，实验室检查可通过病毒学等检查诊断；霉菌性龟头炎由白色念珠菌等真菌感染，与局部卫生等有关，症状有龟头红斑等，实验室检查可通过真菌镜检等确诊，特殊人群中儿童、女性、糖尿病患者有不同特点。
生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，HSV分为HSV-1型和HSV-2型，其中HSV-2型是生殖器疱疹的主要致病类型，主要通过性接触传播，有不洁性生活史者易患病，在机体免疫力低下时（如患有其他疾病、长期劳累等）容易复发。
霉菌性龟头炎：主要是由白色念珠菌等真菌感染引起，多与局部卫生状况不佳有关，比如不经常清洗阴茎、包皮过长且未及时清洁等，长期使用广谱抗生素、糖皮质激素等也可能诱发霉菌性龟头炎，糖尿病患者由于血糖控制不佳，局部糖原含量高，也易继发霉菌性龟头炎。
症状表现方面
生殖器疱疹：
原发感染时，外生殖器部位会出现群集性小水疱，水疱可迅速破溃形成糜烂或浅溃疡，伴有疼痛，同时可能伴有发热、头痛、乏力等全身症状，病程一般2-3周。
复发感染时，症状相对较轻，水疱数目较少，分布较局限，病程较短，一般1-2周可自愈。
霉菌性龟头炎：
主要表现为龟头部位的红斑，表面可有小丘疹、小水疱，随后可出现白色乳酪样分泌物，瘙痒明显，一般全身症状不明显，但病情容易反复发作，在包皮过长的患者中更为常见，局部瘙痒症状在夜间可能会加重。
实验室检查方面
生殖器疱疹：
病毒学检查：可以取水疱底部的分泌物进行涂片，查找单纯疱疹病毒的包涵体，或者进行病毒培养，若培养出单纯疱疹病毒可明确诊断；还可以通过核酸检测技术，如PCR技术检测单纯疱疹病毒的核酸，敏感性和特异性较高。
血清学检查：检测血清中的单纯疱疹病毒抗体，若IgM抗体阳性提示近期有感染，IgG抗体阳性提示既往感染过。
霉菌性龟头炎：
真菌镜检：取龟头部位的分泌物进行涂片，加10%氢氧化钾溶液后镜检，若发现假菌丝或芽孢，即可确诊为真菌感染。
真菌培养：将分泌物接种于真菌培养基上，在适宜的温度下培养，可明确致病的真菌种类，有助于选择针对性的抗真菌药物。
特殊人群方面：
儿童：儿童患生殖器疱疹较为罕见，多因接触了被单纯疱疹病毒污染的物品等感染，而霉菌性龟头炎在儿童中可能与包皮过长、不注意清洁有关，家长应注意儿童的局部卫生，若发现儿童外生殖器有异常表现，应及时就医。
女性：女性感染生殖器疱疹可能会累及宫颈等部位，出现宫颈的炎症表现，而霉菌性龟头炎女性可能会合并霉菌性阴道炎，出现阴道分泌物增多、外阴瘙痒等症状，女性在出现相关症状时应及时就医，进行相应检查以明确诊断。
糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖高，局部环境适合真菌生长，更容易发生霉菌性龟头炎，这类患者除了治疗龟头炎外，还需要积极控制血糖，以减少霉菌性龟头炎的复发。
