霉菌性龟头炎病因包括白色念珠菌感染（自身携带或交叉感染）、其他念珠菌感染（如热带念珠菌等在局部潮湿等环境下感染）、局部环境因素（潮湿多汗、卫生状况差）、机体免疫力低下（基础疾病影响或长期用免疫抑制剂致抵御真菌能力弱）。
自身携带因素：正常人体的口腔、肠道、阴道等部位可能携带白色念珠菌，当局部环境改变时，如机体免疫力下降，白色念珠菌可大量繁殖并侵袭龟头引发炎症。例如，长期患有糖尿病的患者，由于血糖控制不佳，机体免疫力相对较低，且高血糖环境有利于白色念珠菌生长，更容易发生霉菌性龟头炎。对于儿童而言，若存在先天性免疫功能缺陷等情况，也可能因自身携带的白色念珠菌过度增殖而患病。
交叉感染因素：与携带白色念珠菌的异性发生性行为时，可能会被传染。比如女性患有霉菌性阴道炎，在无保护措施的性行为中，男性就有可能感染霉菌性龟头炎。在生活中，共用毛巾、浴盆等个人卫生用品也可能导致间接传播，尤其是免疫力较弱的人群，如儿童或老年人，更容易通过这种方式感染。
其他念珠菌感染
热带念珠菌等感染：除白色念珠菌外，热带念珠菌等其他念珠菌也可引起霉菌性龟头炎。这些念珠菌在特定的环境条件下，如局部潮湿、不注意个人卫生等，会侵犯龟头组织导致炎症发生。例如，长期处于高温潮湿环境工作的男性，会阴部出汗多，局部环境潮湿，为念珠菌滋生创造了条件，增加了感染热带念珠菌等引发霉菌性龟头炎的风险。对于婴幼儿，若尿布更换不及时，局部皮肤处于潮湿状态，也可能因热带念珠菌等感染而出现龟头炎症表现。
局部环境因素
潮湿多汗：会阴部长期处于潮湿多汗的状态，如长时间穿着紧身不透气的内裤、大量运动后未及时清洁等，会使局部湿度增加，为念珠菌等真菌的生长提供了适宜的环境。比如运动员在高强度训练后，会阴部大量出汗，若不能及时清洁和更换衣物，就容易引发霉菌性龟头炎。对于儿童来说，由于新陈代谢旺盛，更容易出汗，若家长未能及时为其清洁会阴部，也易导致局部潮湿，增加患病几率。
卫生状况差：不注意生殖器的清洁卫生，包皮垢堆积，为真菌的生长繁殖提供了丰富的营养物质。例如，一些男性长期不清洗龟头和包皮，包皮垢积聚，会刺激龟头黏膜，同时为念珠菌等真菌营造了良好的生长环境，从而引发霉菌性龟头炎。儿童如果家长疏于帮助其清洁生殖器，也可能因包皮垢堆积而增加患病风险。
机体免疫力低下
基础疾病影响：患有一些慢性疾病，如艾滋病、恶性肿瘤等，会导致机体免疫力明显下降，使身体对念珠菌等真菌的抵御能力减弱，容易发生霉菌性龟头炎。例如，艾滋病患者由于免疫系统遭到严重破坏，念珠菌等机会性感染的发生率大大增加，霉菌性龟头炎就是其中常见的感染表现之一。对于儿童，如果患有先天性免疫缺陷病，其免疫力本身就低于正常儿童，更容易受到念珠菌等真菌的侵袭而患霉菌性龟头炎。
长期使用免疫抑制剂：因疾病需要长期使用免疫抑制剂的患者，如接受器官移植后需长期服用免疫抑制剂的患者，机体免疫力被抑制，也容易引发霉菌性龟头炎。这类患者在用药期间需要特别注意保持生殖器局部清洁，密切关注龟头情况，一旦出现异常及时就医。儿童若因病情需要使用免疫抑制剂，家长更要加强对其生殖器的护理，因为儿童自身免疫力相对较低，使用免疫抑制剂后感染风险进一步增加。
