糜烂性龟头炎的病因包括感染因素和非感染因素。感染因素有细菌（如金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等，可通过直接接触等途径感染）、真菌（如白色念珠菌，糖尿病患者等易感，可通过密切接触等方式感染）、其他病原体（支原体、衣原体、滴虫等，性生活活跃者等易受滴虫通过不洁性行为感染）；非感染因素包括局部刺激（摩擦刺激、化学物质刺激）、包皮过长或包茎（包皮过长易致包皮垢刺激，包茎更易引发炎症）、自身免疫性疾病（如Reiter综合征等可累及龟头引发炎症）。
常见细菌：金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等可引起糜烂性龟头炎。例如，金黄色葡萄球菌常存在于皮肤表面，当局部皮肤黏膜屏障受损时，容易侵入并引发感染。男性若不注意个人卫生，包皮垢堆积等情况可能为细菌滋生提供条件，进而导致感染发生。不同年龄、性别人群都可能因细菌感染而患病，一般来说，卫生状况较差的人群相对更易出现细菌感染相关的糜烂性龟头炎。
感染途径：可通过直接接触被污染的物品、不清洁的性行为等途径感染。对于儿童，若家长护理不当，如尿布更换不及时等，也可能导致细菌感染累及龟头引发炎症。
真菌感染：
常见真菌：白色念珠菌是引起龟头真菌感染常见的病原体。糖尿病患者由于血糖控制不佳，体内环境有利于白色念珠菌生长繁殖，此类人群患真菌性糜烂性龟头炎的风险相对较高。男性若长期使用广谱抗生素、免疫抑制剂等，会破坏体内正常菌群平衡，增加真菌感染的几率。不同性别均可患病，糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂者等属于易感人群。
感染方式：可通过与真菌携带者密切接触、共用卫生洁具等方式感染。例如，在公共浴室、游泳池等场所接触到被白色念珠菌污染的物品后可能被感染。
其他病原体感染：
支原体、衣原体：也可引起龟头的感染性炎症，从而导致糜烂性龟头炎。性生活活跃的人群，尤其是没有采取安全防护措施的情况下，感染支原体、衣原体的风险增加，进而可能引发相关炎症。不同年龄中，性活跃期的人群相对更易受其影响，性别方面无明显特异性差异。
滴虫：阴道毛滴虫感染也可导致男性龟头炎症，通过不洁性行为传播是主要的感染途径，性伴侣患有滴虫性阴道炎时，男性与之发生性行为容易被感染，引发糜烂性龟头炎。
非感染因素
局部刺激：
摩擦刺激：穿着紧身、不透气的内裤，或进行过度剧烈的性行为等，都可能导致龟头局部受到摩擦刺激，引起局部皮肤黏膜损伤，进而容易引发糜烂性龟头炎。不同年龄、性别的人群都可能因摩擦刺激而发病，例如青少年穿着过紧的内裤进行剧烈运动时，或成年人性生活不节制、动作粗暴等情况都可能导致摩擦刺激。
化学物质刺激：使用某些刺激性较强的清洁剂清洗龟头，或局部涂抹不恰当的药物等，都可能对龟头皮肤产生刺激，破坏局部的正常生理环境，引发炎症反应。如部分男性自行使用浓度过高的高锰酸钾溶液清洗龟头，可能因溶液浓度不当刺激龟头导致糜烂性龟头炎。不同人群均可因不当使用化学物质而受影响，一般而言，对化学物质敏感的人群更易出现此类情况。
包皮过长或包茎：
包皮过长：包皮过长时，包皮内板分泌的皮脂等容易积聚形成包皮垢，包皮垢长期刺激龟头及包皮内板，容易引发炎症，包括糜烂性龟头炎。儿童时期包皮过长若不及时处理，随着年龄增长，也可能增加患病风险。对于男性来说，无论年龄大小，包皮过长都是一个潜在的危险因素，可能导致局部炎症反复发作等问题。
包茎：包茎患者包皮口狭窄，包皮难以上翻清洗，更容易导致包皮垢大量堆积，进而刺激龟头引发炎症，相较于包皮过长，包茎引起糜烂性龟头炎的风险更高。新生儿及儿童时期包茎较为常见，若不及时干预，可能影响生殖健康，增加炎症发生的可能性。
自身免疫性疾病：
相关疾病影响：某些自身免疫性疾病可累及龟头部位，引发炎症反应导致糜烂性龟头炎。例如，Reiter综合征等自身免疫性疾病可能出现龟头糜烂等表现。自身免疫性疾病的发生与个体的免疫功能异常有关，不同年龄、性别都可能患病，一般来说，自身免疫功能紊乱的人群更容易受到自身免疫性疾病累及龟头引发相关炎症的影响。
