骨髓移植与造血干细胞移植在细胞来源、采集过程、适用疾病和移植后恢复方面存在区别。细胞来源上骨髓移植主要源于骨髓，造血干细胞来源更广包括外周血和脐带血；采集过程中骨髓移植操作复杂、供者恢复慢，造血干细胞移植中外周血采集简便、脐带血采集简单；适用疾病上骨髓移植用于部分血液系统恶性肿瘤，造血干细胞移植中外周血移植应用广，脐带血移植在儿童某些疾病有独特应用；移植后恢复里骨髓移植恢复造血慢、并发症风险高，造血干细胞移植中外周血恢复快，脐带血恢复造血时间因情况而异且免疫重建缓慢。
骨髓移植：骨髓移植的造血干细胞主要来源于骨髓组织。骨髓位于骨髓腔等部位，抽取骨髓时通常需要在麻醉下进行，操作相对复杂，且供者会有一定痛苦。例如，传统的骨髓移植抽取骨髓的量较大，可能会导致供者术后恢复时间较长。对于儿童等特殊人群，骨髓抽取的风险相对更高，因为儿童骨髓储备量相对较少。
造血干细胞移植：造血干细胞的来源更为广泛，除了骨髓，还可以来源于外周血和脐带血。外周血造血干细胞是通过动员剂使造血干细胞从骨髓释放到外周血中，然后采集外周血得到，这种方式供者痛苦小，恢复快。对于儿童来说，外周血造血干细胞采集相对更易被接受，因为创伤小。脐带血造血干细胞则是从新生儿脐带和胎盘血中采集，对于有相关家族遗传病史等情况的儿童，脐带血可能是一个重要的造血干细胞来源，而且脐带血移植在儿童血液系统疾病等治疗中有独特优势，因为其免疫原性相对较低，移植后的排斥反应相对较轻等。
采集过程方面
骨髓移植：骨髓采集需要在无菌操作下进行，从供者的髂骨等部位抽取骨髓，一般采集量较多，供者术后需要一定时间来恢复骨髓造血功能，可能会出现疼痛、感染等风险。在儿童群体中，由于其骨髓腔相对较窄等特点，骨髓采集的操作难度相对大一些，术后恢复的护理也需要更加精细，要密切关注儿童的疼痛情况和感染迹象等。
造血干细胞移植：外周血造血干细胞采集是通过血细胞分离机，从供者静脉采血，分离出造血干细胞后将其他血液成分回输到供者体内，整个过程相对简便，供者恢复快。脐带血造血干细胞采集相对简单，在新生儿出生后即可进行，对新生儿和产妇无额外伤害。对于儿童患者，如果使用脐带血造血干细胞移植，不需要像骨髓移植那样进行复杂的骨髓抽取操作，减少了儿童在治疗过程中的创伤和痛苦。
适用疾病方面
骨髓移植：在一些血液系统恶性肿瘤等疾病的治疗中有应用，例如某些类型的白血病等。对于一些儿童难治性白血病等疾病，传统的骨髓移植有时是重要的治疗手段，但由于骨髓采集的相关问题，在儿童中的应用需要更加谨慎权衡利弊。
造血干细胞移植：外周血造血干细胞移植在很多血液系统疾病治疗中逐渐成为主要的移植方式，包括一些白血病、淋巴瘤等。对于儿童患者，外周血造血干细胞移植因为其采集过程相对温和，在合适的疾病情况下更常被采用。脐带血造血干细胞移植在儿童遗传性疾病、某些恶性血液病等方面有独特的应用，例如儿童重型地中海贫血等疾病，脐带血移植可以作为一种有效的治疗选择，而且对于HLA配型的要求相对骨髓移植等没有那么严格，因为脐带血自身的免疫特点使得排斥反应相对轻，更适合儿童患者，尤其是HLA配型难以找到合适骨髓供者的儿童患者。
移植后的恢复方面
骨髓移植：骨髓移植后患者恢复造血功能的时间相对较长，因为骨髓的重建需要一定时间，而且术后感染等并发症的风险相对较高。对于儿童患者，由于其自身免疫力相对较低，骨髓移植后的感染防控尤为重要，需要更加严格的无菌护理环境等，并且要密切监测儿童的生长发育情况，因为骨髓移植后的免疫重建等可能会影响儿童的正常生长发育。
造血干细胞移植：外周血造血干细胞移植后恢复造血功能相对较快，因为外周血中本身就含有一定量的成熟血细胞等，而且采集过程对供者影响小，移植后患者恢复相对顺利。脐带血造血干细胞移植后，由于其细胞数量等特点，恢复造血功能的时间可能因个体和疾病情况而异，但总体来说，其免疫重建相对缓慢，对于儿童患者，需要关注其长期的免疫功能恢复情况，以及生长发育等方面的影响，在移植后的护理中要注重营养支持等，以促进儿童的良好恢复。
