厌氧菌肺炎的发生与正常菌群移位、吸入因素、宿主因素及医源性因素相关，正常菌群移位在机体免疫力下降时发生，吸入因素包括口腔厌氧菌及胃肠道内容物误吸，宿主因素有免疫功能低下和基础疾病影响，医源性因素涉及机械通气和胸部手术相关情况。
一、正常菌群的移位
人体呼吸道存在正常菌群，在某些情况下，如机体免疫力下降时，正常定植于上呼吸道的厌氧菌可移位至下呼吸道引发感染。例如，当患者患有慢性阻塞性肺疾病（COPD）时，其呼吸道局部的防御功能减弱，正常菌群的平衡被打破，厌氧菌容易趁机移位到肺部引起肺炎。
二、吸入因素
1.口腔厌氧菌的吸入
口腔中含有大量厌氧菌，当患者有意识障碍（如脑血管意外、麻醉过深等）时，吞咽反射和咳嗽反射减弱或消失，口腔中的厌氧菌容易误吸入肺部。例如，昏迷患者由于不能有效保护气道，口腔分泌物或含有厌氧菌的异物易被吸入肺内，从而引发厌氧菌肺炎。
牙科手术等操作后，口腔内产生的厌氧菌也可能通过误吸进入肺部导致感染。
2.胃肠道内容物的吸入
胃内容物反流误吸也是厌氧菌肺炎的重要病因之一。当患者存在胃食管反流病时，胃酸及胃内的厌氧菌可能反流至食管后被误吸入肺部。尤其是在睡眠时，反流更容易发生，长期卧床的患者由于胃肠蠕动减慢，胃内容物潴留，增加了反流误吸的风险，进而引发厌氧菌肺炎。
三、宿主因素
1.免疫功能低下
患有艾滋病的患者，由于免疫系统严重受损，对病原体的抵御能力大幅下降，容易受到厌氧菌的感染而引发肺炎。
长期使用免疫抑制剂的患者，如接受器官移植后使用免疫抑制剂的患者，其机体的免疫功能受到抑制，对厌氧菌的清除能力减弱，增加了厌氧菌肺炎的发病风险。
2.基础疾病影响
糖尿病患者由于血糖控制不佳时，机体的代谢紊乱，免疫功能受到影响，且高血糖环境有利于厌氧菌的生长繁殖，容易并发厌氧菌肺炎。例如，糖尿病患者血糖长期处于较高水平，为厌氧菌提供了适宜的生存环境，同时自身免疫防御能力下降，使得肺部容易受到厌氧菌的侵袭。
恶性肿瘤患者在接受化疗、放疗过程中，机体免疫力降低，同时肿瘤本身导致机体的营养状况和防御功能进一步恶化，容易发生厌氧菌肺炎。如肺癌患者在化疗后，肺部的正常组织受到一定损伤，局部防御功能降低，厌氧菌容易在肺部定植引发感染。
四、医源性因素
1.机械通气相关
长期进行机械通气的患者，气道的正常防御机制被破坏，细菌容易定植，厌氧菌也不例外。机械通气过程中，气管插管或气管切开等操作破坏了呼吸道的屏障功能，增加了厌氧菌进入肺部的机会，从而引发厌氧菌肺炎。
2.胸部手术相关
胸部手术尤其是涉及呼吸道的手术，如肺癌切除术等，手术过程中可能导致肺部组织损伤，术后患者的呼吸功能受到一定影响，呼吸道分泌物排出不畅，为厌氧菌在肺部生长繁殖创造了条件，增加了厌氧菌肺炎的发生风险。
