百日咳发病率上升与多因素相关，包括儿童存在未及时或漏种疫苗情况、成人接种意识或程序不完善，群体免疫水平不足且免疫保护时效下降，百日咳杆菌可能基因变异逃避免疫，人口流动扩大传播范围，以及诊断方法改进和报告系统完善致统计上发病率看似逐年提升。
一、疫苗接种覆盖率因素
（一）儿童疫苗接种程序执行情况
儿童是百日咳的高发易感人群，按免疫程序应规律接种百日咳疫苗，但部分儿童存在未及时接种或漏种情况。例如，一些家庭可能因疏忽未能按时带儿童前往接种点完成全程疫苗接种，导致儿童对百日咳杆菌缺乏足够的特异性免疫保护，当接触到百日咳杆菌时易发病，从而影响人群整体对百日咳的免疫屏障构建，使得发病率有上升趋势。
（二）成人疫苗接种相关情况
成年人中也存在疫苗接种意识淡薄或疫苗接种程序不完善的情况。部分成年人可能未接种过百日咳疫苗或未及时进行加强免疫，当他们与易感人群接触时，可能成为传染源传播百日咳杆菌，进一步影响整体发病率。
二、免疫屏障因素
（一）群体免疫水平不足
当人群中百日咳疫苗接种率未达到足够高的水平时，无法形成有效的群体免疫屏障。例如，若社区内疫苗接种率低于一定阈值，百日咳杆菌就容易在人群中传播扩散，导致更多人感染发病，使得整体发病率呈现上升态势。
（二）免疫保护的时效性
百日咳疫苗接种后产生的免疫力会随时间推移逐渐下降，若未及时进行加强免疫，人群的免疫保护水平会降低，从而增加了百日咳的发病风险，促使发病率逐年提升。
三、病原体变异因素
（一）百日咳杆菌基因变异
百日咳杆菌可能发生基因变异，变异后的菌株可能逃避疫苗诱导的免疫反应。比如，变异菌株的表面抗原等结构发生改变，使得原本接种疫苗所产生的抗体无法有效识别和中和变异后的菌株，进而导致更多人感染发病，影响发病率统计。
四、人口流动因素
（一）人员流动对疾病传播的影响
随着社会经济发展，人口流动日益频繁。人员在不同地区、人群之间流动时，容易将百日咳杆菌从发病率相对较高的地区带到发病率相对较低的地区，或者在不同易感人群集中的场所传播，如学校、托幼机构等人员密集处，从而扩大了百日咳的传播范围，使得整体发病率有上升趋势。
五、诊断报告因素
（一）诊断方法改进与报告系统完善
近年来，诊断百日咳的方法不断改进，如核酸检测等更精准的检测手段被应用，使得更多以往可能被漏诊或误诊的百日咳病例被准确诊断出来。同时，疾病报告系统的不断完善也使得更多病例能够被及时、准确地报告，这就导致在统计数据上百日咳的发病率看似逐年提升，而实际上是诊断和报告的准确性与全面性提高所带来的变化。对于儿童等特殊人群，由于其临床症状可能不典型，更需要借助精准的诊断方法来明确病例，而完善的报告系统能让卫生部门更好地掌握疾病流行情况并采取防控措施；对于成年人，也需依据准确的诊断来评估自身健康风险及参与防控工作。
