灼口综合症的发生与局部因素、全身因素及精神心理因素有关。局部因素包括口腔局部感染、牙石及不良修复体刺激；全身因素涉及内分泌紊乱（更年期女性、其他内分泌疾病）、系统疾病（维生素及矿物质缺乏、神经系统疾病、自身免疫性疾病）；精神心理因素有焦虑抑郁等情绪障碍及精神因素导致的异常感觉。
牙石、不良修复体等刺激：牙石的存在会持续刺激牙龈和口腔黏膜，不良修复体的边缘不贴合、表面不光滑等情况也会反复摩擦口腔组织，长期的机械性刺激可能导致口腔黏膜的感觉异常，引发灼口综合症。比如，不合适的假牙边缘可能会不断摩擦舌侧或颊侧黏膜，使局部组织处于应激状态，影响神经功能，出现灼口症状。
全身因素
内分泌紊乱
更年期女性：更年期女性体内雌激素水平大幅下降，会引起内分泌失调。雌激素对口腔黏膜的血液循环、感觉神经等有一定的调节作用，雌激素水平降低可能导致口腔黏膜干燥、感觉神经敏感性增强，从而引发灼口综合症。研究表明，更年期女性患灼口综合症的概率明显高于其他年龄段女性。
其他内分泌疾病：如糖尿病，血糖控制不佳时，高血糖环境可能影响神经的代谢和功能，导致神经病变，其中就包括口腔神经的病变，可能引发灼口症状；甲状腺功能减退等内分泌疾病也可能通过影响机体的代谢、神经调节等方面，增加灼口综合症的发病风险。
系统疾病
维生素及矿物质缺乏：缺乏维生素B族（如B1、B2、B6、B12等）以及铁、锌等矿物质时，会影响口腔黏膜的正常代谢和神经功能。例如，维生素B2参与体内生物氧化与能量代谢，缺乏时可引起口角炎、唇炎等口腔黏膜病变，同时可能伴有口腔灼热感；锌元素是很多酶的组成成分，对维持口腔黏膜的完整性和正常功能有重要作用，缺锌可能导致口腔黏膜修复能力下降，出现灼口不适。
神经系统疾病：如三叉神经病变、舌咽神经痛等神经系统疾病，会直接影响口腔区域的神经传导，导致感觉异常，表现为灼口综合症的症状。例如，三叉神经的分支分布在口腔周围，若三叉神经发生病变，其传导的感觉信号出现异常，就可能让患者感觉口腔有灼热、疼痛等不适。
自身免疫性疾病：像干燥综合征等自身免疫性疾病，患者体内的自身抗体攻击唾液腺等组织，导致唾液分泌减少，口腔干燥，同时自身免疫反应也可能累及口腔黏膜神经，引发灼口综合症。干燥综合征患者常出现眼干、口干等症状，口腔干燥会使口腔黏膜更容易受到损伤，并且神经敏感性增加，从而出现灼热疼痛等表现。
精神心理因素
焦虑、抑郁等情绪障碍：长期处于焦虑、抑郁状态的人群，其神经内分泌系统会发生紊乱，影响神经递质的平衡，如5-羟色胺、多巴胺等神经递质的异常可能导致感觉阈值降低，使患者对口腔内的正常感觉过于敏感，产生灼口的主观感受。例如，一些患者在经历生活中的重大事件后，出现长期的焦虑情绪，随后逐渐出现口腔灼热不适的症状，经心理评估发现存在明显的焦虑状态。
精神因素导致的异常感觉：部分患者可能存在精神心理方面的暗示或错误认知，将一些正常的口腔感觉放大，从而感觉口腔有灼热感等不适。比如，患者听说某种口腔疾病会有灼热症状后，过度关注自己的口腔，不断强化这种感觉，即使口腔并无实质性病变，也会主观认为自己患有灼口综合症。
