牙根尖周炎拔牙髓后牙还是疼的常见原因包括炎症未完全控制（感染扩散、根尖周组织破坏范围广）、根管治疗不完善（根管充填不到位、根管预备不彻底）以及其他因素（牙齿劈裂、牙周组织问题），不同年龄、生活方式、基础病史等因素会对这些原因产生影响。
感染扩散：牙根尖周炎是根管内感染物通过根尖孔引起根尖周组织的炎症。拔牙髓只是去除了髓腔内的部分感染物质，但根尖周的炎症可能仍存在，感染可能向周围组织扩散，导致疼痛持续。例如，根管内的细菌及其毒素未被彻底清除，炎症继续刺激周围的神经末梢，引起疼痛。不同年龄阶段的患者，身体的免疫力不同，儿童的免疫系统相对较弱，炎症控制可能较成人慢，疼痛持续时间可能更长；而老年人身体机能衰退，炎症消退也相对缓慢。生活方式方面，长期吸烟的患者，烟草中的有害物质会影响局部血液循环，不利于炎症的消退，可能使疼痛持续。有糖尿病等基础病史的患者，血糖控制不佳时，机体的抗感染能力下降，根尖周炎症更难控制，疼痛更容易迁延不愈。
根尖周组织破坏范围广：如果牙根尖周炎已经造成较大范围的根尖周组织破坏，即使拔除了牙髓，炎症的修复需要时间，在修复过程中仍可能出现疼痛。比如根尖周已有较大的脓肿形成，仅拔除牙髓不能立即消除脓肿对周围组织的刺激，疼痛就会持续。
根管治疗不完善
根管充填不到位：根管充填是根管治疗的重要步骤，若根管充填材料没有严密填充根管系统，遗留有缝隙，细菌可能再次侵入，引发炎症反应导致疼痛。不同性别患者在根管治疗操作中的反应可能有差异，但对根管充填效果的影响主要在于操作的规范性。生活方式中，经常饮用碳酸饮料等会对牙齿造成酸蚀的患者，根管治疗后牙齿的抗龋能力和稳定性下降，即使根管充填完善，也可能因其他因素导致牙齿敏感等类似疼痛的情况。有夜磨牙习惯的患者，会增加牙齿的受力，影响根管治疗后牙齿的状况，可能导致疼痛持续。
根管预备不彻底：根管预备没有将根管内的感染物质、牙本质碎屑等清理干净，残留的感染物质会持续刺激根尖周组织，引起疼痛。儿童在根管预备时，由于牙齿解剖结构相对特殊，操作难度较大，更容易出现根管预备不彻底的情况，从而导致疼痛持续。女性患者在孕期进行根管治疗时，由于身体的特殊生理状态，根管预备的操作需要更加谨慎，否则容易因根管预备不彻底引发术后疼痛。
其他因素
牙齿劈裂：拔牙髓后牙齿失去了牙髓的营养供应，变得相对脆弱。如果患者在治疗后咬合力过大或受到外力撞击，可能导致牙齿劈裂，引起疼痛。不同年龄阶段牙齿的硬度和韧性不同，儿童牙齿相对较嫩，更容易劈裂；老年人牙齿磨损严重，也较脆弱。生活方式中，喜欢咀嚼硬物的患者，如经常嗑瓜子、咬坚果等，会增加牙齿劈裂的风险，导致拔牙髓后疼痛持续。有颞下颌关节紊乱病史的患者，咀嚼功能异常，可能在不自觉中加大牙齿的受力，增加牙齿劈裂的可能性。
牙周组织问题：牙根尖周炎可能同时伴有牙周组织的病变，拔牙髓后，牙周组织的炎症也可能导致疼痛。例如牙周袋内的细菌感染扩散到根尖周区域，或者根尖周炎症影响到牙周组织，即使牙髓问题解决了，牙周组织的炎症仍存在，引起疼痛。儿童时期如果有不良的口腔卫生习惯，容易引发牙周组织问题，成年后根尖周炎拔牙髓后可能因既往的牙周问题导致疼痛持续。女性在经期时，身体的免疫力会有所下降，牙周组织的炎症可能加重，导致拔牙髓后牙更疼的情况更易发生。
