口水臭可能由多种因素引起，包括口腔局部因素如龋齿、牙龈炎、牙周炎、智齿冠周炎；全身系统性疾病如消化系统的反流性食管炎、消化不良，呼吸系统的鼻窦炎、扁桃体炎；不良生活习惯如口腔卫生不良、长期吸烟、大量饮酒；以及长期服用某些药物、精神压力过大等其他因素。
牙龈炎：牙菌斑、牙结石等局部刺激物长期堆积在牙龈边缘，会引发牙龈炎症，牙龈会出现红肿、易出血等症状，同时细菌滋生产生异味，导致口水臭。青少年和成年人都可能因口腔卫生不良患上牙龈炎，女性在生理期由于激素变化可能会加重牙龈炎症状，进而使口水臭更明显。
牙周炎：牙周炎是比牙龈炎更严重的牙周组织疾病，除了牙龈炎症外，还会出现牙周袋形成、牙槽骨吸收等情况，牙周袋内会有大量炎性分泌物和细菌，产生恶臭，导致口水臭。中老年人是牙周炎的高发人群，长期吸烟的人患牙周炎的风险更高，口水臭的概率也更大。
智齿冠周炎：智齿萌出不全或阻生时，牙冠周围软组织发生炎症，局部会出现肿胀、疼痛，细菌感染后会有脓性分泌物，散发出臭味，从而引起口水臭。年轻人智齿萌出期较易出现智齿冠周炎，女性在智齿萌出时由于身体激素等变化，可能也会相对更敏感。
全身系统性疾病
消化系统疾病
反流性食管炎：胃内容物反流至食管，甚至口腔，其中的胃酸等物质会导致口腔异味，包括口水臭。肥胖人群、老年人由于食管下括约肌功能相对较弱，更容易发生反流性食管炎。妊娠女性在孕期由于激素变化和子宫增大压迫胃部，也可能出现反流性食管炎相关口水臭情况。
消化不良：胃肠蠕动减慢，食物在胃肠道内停留时间过长，发酵产生异味，可能会通过食管反流至口腔，引起口水臭。饮食不规律、暴饮暴食的人容易出现消化不良，儿童如果进食过多不易消化的食物也可能导致消化不良进而口水臭。
呼吸系统疾病：如鼻窦炎、扁桃体炎等。鼻窦炎患者鼻腔内的脓性分泌物倒流至咽部，会产生臭味，导致口水臭；扁桃体炎时扁桃体隐窝内积存脓栓等，也会散发异味，引起口水臭。老年人由于呼吸道防御功能下降，更容易患呼吸系统疾病导致口水臭。
不良生活习惯
口腔卫生不良：不按时刷牙、刷牙方法不正确、很少使用牙线等，会导致食物残渣在口腔内长时间残留，细菌大量繁殖，产生口水臭。儿童如果家长没有帮助其养成良好的口腔卫生习惯，很容易出现口腔卫生不良导致口水臭；成年人如果工作繁忙等原因忽视口腔清洁，也会出现这种情况。
长期吸烟：烟草中的尼古丁等成分会残留在口腔中，并且吸烟会抑制唾液分泌，唾液有清洁口腔的作用，唾液分泌减少会使口腔自洁能力下降，从而导致口水臭。长期吸烟的人牙齿表面往往有烟渍，口腔异味较重。
大量饮酒：酒精会影响口腔黏膜的正常功能，使口腔干燥，同时酒精代谢产物会通过口腔呼出，导致口水臭。过量饮酒后第二天晨起时口水臭的情况较为常见，尤其对于本身有口腔问题的人，饮酒后口水臭会更明显。
其他因素
长期服用某些药物：例如抗组胺药、降压药等，可能会引起口干，从而导致口水臭。老年人由于常需服用多种药物，要留意药物可能引起的口干等副作用导致的口水臭情况。
精神压力过大：精神压力过大时会影响神经系统对唾液分泌的调节，导致唾液分泌减少，口腔自洁作用减弱，出现口水臭。长期处于高压工作状态的人群，如上班族等，可能会因精神压力大出现口水臭问题，儿童在考试等压力情境下也可能出现类似情况。
