分离焦虑症的发生与遗传因素、神经生物学因素、心理社会因素及个体自身因素有关。遗传上家族有相关病史风险增加；神经生物学方面神经递质失衡、大脑结构功能异常可致；心理社会中早期过度保护、养育环境不稳定及重大生活事件、创伤性经历会引发；个体自身性格内向敏感胆小及认知水平偏差易患病。
神经生物学因素
大脑神经递质：如血清素、多巴胺等神经递质的失衡可能与分离焦虑症有关。血清素在调节情绪、焦虑等方面起着重要作用，当血清素水平异常时，可能导致个体对分离情境的反应过于敏感和强烈。例如，有研究发现，分离焦虑症患者脑内的血清素转运体功能可能存在异常，影响了血清素的转运和调节，从而引发焦虑情绪。
大脑结构和功能：大脑中的一些区域，如杏仁核、海马体等与情绪和记忆调节密切相关。杏仁核在处理恐惧和焦虑情绪中起关键作用，当个体面临分离情境时，杏仁核的过度激活可能导致强烈的焦虑反应。海马体与记忆有关，对于环境的熟悉程度等记忆因素也会影响个体对分离的适应，若海马体功能异常，可能影响个体对分离相关情境的正常认知和应对，进而引发分离焦虑症。在儿童发育过程中，如果大脑的这些结构和功能发育出现异常，也可能增加患分离焦虑症的风险。
心理社会因素
早期养育方式
过度保护：如果父母对孩子过度保护，事事包办，孩子缺乏独立应对外界环境的机会和经验，那么当面临与父母分离等情境时，就容易出现强烈的分离焦虑。例如，孩子从小一直由父母陪伴，从未独自面对过陌生环境或与父母短暂分离的情况，当进入幼儿园等新环境需要与父母分离时，就会因为缺乏应对经验而产生严重的焦虑情绪。
养育环境不稳定：频繁更换抚养人、居住环境等不稳定的养育环境会让孩子缺乏安全感。孩子难以建立稳定的依恋关系，在面对分离时就更容易出现焦虑反应。比如，孩子在成长过程中多次更换保姆或者搬家，导致与主要抚养人的依恋关系不稳定，那么在遇到分离情境时，就会表现出比正常孩子更强烈的分离焦虑。
生活事件影响
重大生活变化：如家庭成员的离世、父母离婚、搬家、转学等重大生活事件，会给孩子带来心理上的冲击，打破原有的生活平衡，使孩子产生不安全感，从而引发分离焦虑症。例如，孩子原本在一个稳定的家庭环境中生活，父母离婚后，孩子的生活发生巨大变化，可能会对与主要抚养人的分离更加敏感，出现严重的分离焦虑。
创伤性经历：如果孩子在成长过程中经历过与分离相关的创伤性事件，如被陌生人强行带走等，那么再次面临分离情境时，就会触发强烈的焦虑反应。这种创伤性经历会在孩子的心理上留下深刻的印记，导致其对分离产生过度的恐惧和焦虑。
个体自身因素
性格特点：一些性格内向、敏感、胆小的个体更容易患上分离焦虑症。这类个体对环境变化的适应能力相对较弱，对分离情境的感知更为敏锐，从而更容易出现过度的焦虑反应。例如，在幼儿园中，那些性格内向的孩子往往比性格开朗的孩子更难适应与父母的分离，更容易出现分离焦虑的情绪和行为表现。
认知水平：儿童的认知发展水平会影响其对分离的理解和应对。年龄较小的儿童认知发展不完善，往往不能正确理解分离只是暂时的，容易将分离视为永久性的失去，从而产生强烈的焦虑。随着年龄的增长，认知水平逐渐提高，对分离的理解更加客观，分离焦虑的程度可能会相对减轻。但如果在认知发展过程中存在偏差，也可能导致分离焦虑症的发生。比如，一个认知发展滞后的儿童可能无法正确认识到父母离开后还会回来，进而持续处于焦虑状态。
