疱疹性口炎是否会自愈，需要分情况判断。
年龄对疱疹性口炎的自愈情况有显著影响。婴幼儿免疫系统尚未发育完全，抵抗力较弱，感染疱疹性口炎后，症状可能较为严重，如发热、流涎、拒食等，自愈过程相对较慢，且可能出现并发症，如脱水、电解质紊乱等，因此较难自愈。而成人免疫系统较为成熟，在感染后，若症状较轻，多数情况下能够依靠自身免疫力在12周内自愈。免疫功能正常的人群，身体的免疫系统能够有效识别和清除病毒，促进病情的恢复，自愈的可能性较大。但对于免疫功能低下的人群，如患有艾滋病、正在接受化疗或长期使用免疫抑制剂的患者，免疫系统无法正常发挥作用，难以有效对抗病毒，疱疹性口炎不仅难以自愈，还可能反复发作，病情迁延不愈。
根据病情，医生可能会开具抗病毒药物来抑制病毒的复制，减轻症状，缩短病程。此外，还可能会使用一些对症治疗的药物，如退烧药、止痛药、促进黏膜修复的药物等。在治疗期间，患者应注意保持口腔清洁，使用淡盐水漱口，避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重疼痛。同时，要保证充足的睡眠和休息，多喝水，多吃富含维生素的水果和蔬菜，以增强身体的抵抗力。
