急性肾盂肾炎的发生机制包括病原体感染途径和机体自身因素。病原体感染途径有上行感染（女性因尿道短宽等易发生，性生活等可诱发，儿童尿道畸形可增加风险）、血行感染（免疫力低下或某些情况时，如糖尿病患者易发生）、淋巴道感染（罕见，盆腔和腹腔感染可通过淋巴管感染肾脏）；机体自身因素有尿路梗阻（尿路结石等致尿液排出不畅易诱发）、机体免疫力低下（长期用免疫抑制剂、糖尿病、老年人等易发病）、膀胱-输尿管反流（儿童常见，可致细菌带入肾脏引发感染及肾脏瘢痕形成）。
一、病原体感染途径
1.上行感染
这是最主要的感染途径。女性由于尿道短而宽，且距离肛门较近，更容易发生上行感染。细菌（最常见的是大肠埃希菌）从尿道外口进入尿道，然后沿尿道上行至膀胱，再经输尿管蔓延至肾盂，引起肾盂肾炎。例如，性生活是女性发生上行感染的一个常见诱因，性交时可能将尿道周围的细菌挤入尿道，进而导致感染向肾盂蔓延。对于儿童，如存在尿道畸形等情况，也可能增加上行感染的风险，尿道畸形会使尿液引流不畅，有利于细菌的定植和繁殖。
2.血行感染
较少见，但在机体免疫力低下或某些情况下可发生。细菌从身体其他部位的感染灶侵入血流，随血液循环到达肾脏引起肾盂肾炎。例如，皮肤感染（如疖、痈等）、呼吸道感染等，病原菌可通过血行播散到肾脏。在糖尿病患者中，由于机体免疫力相对较低，血行感染的风险可能增加，高血糖环境有利于细菌的生长繁殖，且糖尿病患者常存在血管病变，影响肾脏的血液供应和免疫防御功能，使得病原菌更容易在肾脏定植引发感染。
3.淋巴道感染
更为少见。盆腔和腹腔的感染可通过淋巴管感染肾脏。比如，患有盆腔炎的女性，病原菌可能通过淋巴管蔓延至肾脏，引起肾盂肾炎，但这种情况相对罕见。
二、机体自身因素
1.尿路梗阻
任何导致尿液排出不畅的因素都可诱发肾盂肾炎。如尿路结石、前列腺增生、输尿管狭窄等。尿路梗阻时，尿液潴留，细菌容易在局部繁殖，而且尿液引流不畅会使肾脏组织压力增高，影响肾脏的正常功能和免疫防御机制，从而增加肾盂肾炎的发生风险。对于老年男性，前列腺增生较为常见，这会导致尿道梗阻，尿液排出受阻，是老年男性发生肾盂肾炎的一个重要危险因素。儿童如果存在先天性尿路畸形，如肾盂输尿管连接部狭窄等，也会引起尿路梗阻，进而易发生肾盂肾炎。
2.机体免疫力低下
当人体免疫力下降时，容易遭受病原体感染。例如，长期使用免疫抑制剂的患者，如接受器官移植后需要长期服用免疫抑制剂的患者，其机体的免疫功能受到抑制，对细菌的清除能力减弱，容易发生肾盂肾炎。糖尿病患者由于血糖控制不佳，高血糖环境不利于白细胞的杀菌功能，同时糖尿病患者常合并神经病变，导致膀胱功能异常，尿液潴留，也使得机体免疫力低下，增加肾盂肾炎的发病几率。老年人的机体免疫力相对较低，尤其是伴有基础疾病（如糖尿病、高血压等）的老年人，更容易发生肾盂肾炎。
3.膀胱-输尿管反流
在儿童中较为常见，由于儿童的膀胱-输尿管反流机制发育不完善。当膀胱收缩时，尿液可从膀胱逆流至输尿管甚至肾盂，从而将细菌带入肾脏引起感染。如果存在膀胱-输尿管反流，即使没有明显的尿路梗阻，也容易发生肾盂肾炎，而且反复的膀胱-输尿管反流可能导致肾脏瘢痕形成，影响肾脏的长期功能。
