肾囊肿症状分无症状和有症状表现。多数小肾囊肿及孤立性单纯性肾囊肿初期无症状；有症状表现包括囊肿较大时的压迫症状（压迫肾脏周围组织致腰部胀痛、压迫邻近器官致消化不良等）、血尿、高血压、腹部肿块、感染相关症状（发热、腰痛加剧、白细胞升高等），且不同人群症状可能不同，有肾囊肿者需定期检查。
多数小肾囊肿情况：很多较小的肾囊肿通常没有明显症状，这是因为囊肿对肾脏结构和功能的影响非常轻微，不影响肾脏的正常生理过程，所以患者往往不会感觉到身体有异常变化。例如，一些在体检中偶然发现的直径小于2-3厘米的肾囊肿，患者可能长时间都没有任何不适症状。
孤立性单纯性肾囊肿初期：孤立性单纯性肾囊肿在初期时，肾脏的形态和功能尚未受到明显干扰，也可能没有症状。这种囊肿大多是单个发生，起源于肾小管，早期生长缓慢，对周围组织的压迫等影响较小。
有症状表现
囊肿较大时的压迫症状
对肾脏周围组织压迫：当肾囊肿较大时，比如直径超过5厘米甚至更大，可能会压迫肾脏周围的组织，如压迫肾实质、肾盂等结构。如果压迫肾盂，可能会导致尿路梗阻，引起腰部胀痛等不适。这种胀痛通常是隐痛或钝痛，疼痛的程度和部位可能因囊肿的具体位置不同而有所差异。例如，位于肾脏下极的较大囊肿可能会引起下腰部的胀痛；
对邻近器官压迫：巨大的肾囊肿还可能压迫邻近器官，如压迫十二指肠等，可能会引起消化不良、上腹部不适等症状，但这种情况相对较少见。
血尿：部分肾囊肿患者可能出现血尿症状。这是因为囊肿壁上的血管可能会因为囊肿的牵拉等原因发生破裂，从而导致血尿。血尿可以表现为镜下血尿，即通过显微镜检查尿液才能发现红细胞；也可以是肉眼血尿，尿液呈现红色。不过，血尿的出现并不是所有肾囊肿患者都会有的症状，其发生概率与肾囊肿的大小、类型等因素有关。一般来说，较大的肾囊肿发生血尿的可能性相对较高。
高血压：肾囊肿可能会引起高血压，这被称为肾性高血压。其发生机制可能与囊肿压迫肾脏，导致肾脏缺血，激活肾素-血管紧张素-醛固酮系统有关。当肾素分泌增加时，会使血管紧张素Ⅱ生成增多，引起血管收缩，血压升高。患有肾囊肿的患者如果出现高血压症状，如头晕、头痛等，需要引起重视，因为高血压可能会进一步加重肾脏的损害。例如，一些研究发现，在肾囊肿患者中，约有10%-40%的患者可能合并有高血压。
腹部肿块：当肾囊肿体积较大时，患者自己可能在腹部摸到肿块。肿块通常质地较软，表面光滑，一般没有明显压痛。例如，直径大于10厘米的肾囊肿，腹部触及肿块的可能性增加。但需要注意与其他腹部肿块相鉴别，如肾脏肿瘤等。
感染相关症状：如果肾囊肿发生感染，患者可能出现发热、腰痛加剧、白细胞升高等症状。感染的发生可能是因为囊肿内的液体成为细菌滋生的环境，或者囊肿与外界相通等原因导致。例如，患者可能突然出现高热，体温可达38℃以上，同时腰部疼痛明显加重，类似于肾盂肾炎的表现，但又有肾囊肿的基础疾病存在。
不同年龄、性别、生活方式和病史的人群肾囊肿症状可能有所不同。例如，老年患者可能对疼痛等症状的感知不如年轻人敏感，所以症状可能相对不典型；女性患者在一些特殊生理时期，如妊娠期，肾囊肿可能因为肾脏负担加重等原因导致症状变化；长期高蛋白饮食、高血压、糖尿病等病史的人群，肾囊肿相关症状可能会更早出现或者症状相对更明显。对于有肾囊肿的人群，无论何种情况，都需要定期进行肾脏相关检查，如超声检查等，密切观察囊肿的变化情况，以便及时发现症状变化并采取相应的措施。
