需与心脏神经官能症鉴别的疾病有冠心病、甲状腺功能亢进、二尖瓣脱垂综合征、更年期综合征等，与冠心病鉴别从症状特点和辅助检查方面区分，与甲状腺功能亢进从症状表现和实验室检查区分，与二尖瓣脱垂综合征从症状和超声心动图等区分，与更年期综合征从发病群体、症状特点及激素水平检查区分，特殊人群需注意相关鉴别，且不同人群应根据各自情况调整生活方式。
一、与冠心病鉴别
1.症状特点
心脏神经官能症：症状多样且不典型，常有心悸、心前区疼痛等，但疼痛部位不固定，性质多为针刺样、牵扯样或隐痛等，疼痛持续时间长短不一，一般较长，可数小时甚至数天，且与活动无关，休息时也可发作，同时还常伴有其他神经官能症症状，如失眠、焦虑、多汗等。
冠心病：典型心绞痛多位于胸骨后或心前区，呈压榨性、闷痛或紧缩感，一般持续3-5分钟，常由体力活动、情绪激动等诱发，休息或含服硝酸甘油后可缓解，若为急性心肌梗死，疼痛程度更剧烈，持续时间更长，可伴有大汗、恶心、呕吐等症状，且疼痛与活动等有明确关联。
2.辅助检查
心电图：心脏神经官能症患者静息心电图大多正常，部分可出现ST-T改变，如T波低平、倒置等，但动态变化不明显；冠心病患者在心绞痛发作时可出现ST段压低、T波倒置等缺血性改变，心电图负荷试验可协助诊断，急性心肌梗死时心电图有特征性和动态性改变，如ST段抬高呈弓背向上型、出现病理性Q波等。
冠状动脉造影：这是诊断冠心病的金标准，可直接观察冠状动脉是否存在狭窄、阻塞及其部位、程度等，心脏神经官能症患者冠状动脉造影无异常。
二、与甲状腺功能亢进鉴别
1.症状表现
心脏神经官能症：主要以心血管系统功能紊乱表现为主，虽可有心悸等，但一般无甲状腺功能亢进的典型全身表现，如怕热、多汗、消瘦、食欲亢进、手抖等。
甲状腺功能亢进：除了心悸、心动过速等心血管症状外，有明显的甲状腺功能亢进的全身表现，甲状腺可肿大，血中甲状腺激素水平升高，促甲状腺激素降低等。
2.实验室检查
甲状腺功能亢进患者血清甲状腺素（T4）、三碘甲状腺原氨酸（T3）、游离T4（FT4）、游离T3（FT3）等指标升高，促甲状腺激素（TSH）降低；心脏神经官能症患者甲状腺功能指标正常。
三、与二尖瓣脱垂综合征鉴别
1.症状方面
心脏神经官能症：症状不具特异性二尖瓣脱垂综合征的典型特点，二尖瓣脱垂综合征患者除了可能有心悸、胸痛等症状外，听诊可闻及收缩中晚期喀喇音，超声心动图可发现二尖瓣脱垂的特征性改变。
二尖瓣脱垂综合征：除了上述心脏相关症状外，超声心动图显示二尖瓣叶收缩期脱入左心房，超过二尖瓣环水平等典型表现。
四、与更年期综合征鉴别
1.发病群体及症状特点
心脏神经官能症：可发生于各个年龄段，但多见于青中年，症状以心血管症状及神经官能症表现为主，与更年期无必然的年龄相关性。
更年期综合征：主要发生于女性绝经前后，除了可能有心慌等心血管症状外，还有明显的雌激素水平下降相关表现，如月经紊乱、潮热、情绪波动大等。
2.激素水平检查
更年期综合征患者性激素水平有明显变化，如雌激素降低等，而心脏神经官能症患者性激素水平正常。
特殊人群方面，对于儿童，心脏神经官能症相对较少见，若儿童出现类似心脏不适症状，需首先排除先天性心脏病等器质性疾病；对于老年人，要注意与冠心病等老年常见心血管疾病鉴别，因为老年人基础疾病多，需更全面细致地进行各项检查以明确诊断，避免漏诊或误诊。在生活方式方面，有心脏神经官能症的人要注意避免过度劳累、精神紧张等诱发因素，保持良好的心态和生活规律；而对于其他需要鉴别的疾病相关人群，也应根据各自疾病特点调整生活方式，如甲亢患者要低碘饮食等。
