复杂性先天性心脏病的发生与遗传因素和环境因素相关。遗传因素包括染色体异常（如21-三体综合征常合并多种心脏畸形，染色体特定基因异常影响心脏发育）和单基因遗传（如Nkx2-5基因突变更心脏畸形）；环境因素有母亲孕期感染（如风疹病毒致婴儿患多种心脏畸形）、接触有害物质（如有机溶剂、铅影响心脏发育）、不良生活习惯（如酗酒致胎儿心脏结构异常）、患有某些疾病（如糖尿病使婴儿患先天性心脏病概率升高）。
1.染色体异常：许多复杂性先天性心脏病与染色体异常相关。例如21-三体综合征（唐氏综合征），约50%的唐氏综合征患儿合并有先天性心脏病，其中常见的有室间隔缺损、房间隔缺损等复杂性心脏畸形。研究表明，染色体上特定基因的缺失、重复或突变会影响心脏发育相关基因的正常表达，从而导致心脏结构和功能的异常。在性别方面，不同染色体异常导致的先天性心脏病在男女中的发生比例可能存在差异，但主要是由染色体本身的异常机制决定心脏发育的异常。对于有家族遗传病史的人群，尤其是家族中有先天性心脏病患者且伴有染色体异常相关表现的，生育时需要进行遗传咨询和产前诊断，以评估胎儿患复杂性先天性心脏病的风险。
2.单基因遗传：某些单基因的突变也可引起复杂性先天性心脏病。比如Nkx2-5基因的突变，该基因在心脏发育的早期起着关键作用，调控心脏多种结构蛋白的表达。如果该基因发生突变，会导致心脏在发育过程中出现房室间隔发育不全、心肌结构异常等多种复杂性心脏畸形。单基因遗传导致的先天性心脏病在不同年龄人群中均可发生，但由于单基因的突变是特定的，对于有单基因遗传疾病家族史的家庭，备孕夫妇需要进行基因检测，明确相关致病基因，在孕期可以通过基因检测技术监测胎儿是否携带致病基因，从而采取相应的措施。
环境因素
1.母亲孕期感染：母亲在孕期感染某些病毒是导致复杂性先天性心脏病的重要环境因素之一。例如母亲在妊娠早期感染风疹病毒，风疹病毒可以通过胎盘侵犯胎儿，干扰心脏的正常发育过程。研究发现，孕期感染风疹病毒的孕妇所生婴儿患先天性心脏病的风险明显升高，可能出现动脉导管未闭、肺动脉狭窄、室间隔缺损等多种复杂性心脏畸形。在生活方式方面，母亲在孕期如果接触到风疹病毒等病原体，需要及时就医并进行相关检查。对于育龄女性，在计划怀孕前应接种风疹疫苗，以降低孕期感染风疹病毒的风险。不同年龄的女性在孕期感染风险可能不同，一般来说，育龄女性是主要的孕期人群，需要特别注意孕期的感染防控。
2.母亲孕期接触有害物质：母亲孕期接触某些有害物质也会增加胎儿患复杂性先天性心脏病的风险。例如孕期接触有机溶剂、铅等有害物质。有机溶剂中的苯等物质可以通过胎盘影响胎儿的心脏发育，铅则会干扰胎儿体内的代谢过程，影响心脏发育相关的酶和蛋白质的合成。母亲在职业环境中如果接触到这些有害物质，需要调整工作环境，避免继续接触。在生活方式上，要避免接触家庭装修中残留的有害物质等。对于孕期女性，尤其是从事特殊职业可能接触有害物质的人群，需要进行职业暴露评估，并采取防护措施，以减少胎儿患复杂性先天性心脏病的风险。
3.母亲孕期不良的生活习惯：母亲孕期酗酒也会对胎儿心脏发育产生不良影响。孕妇酗酒时，酒精中的乙醇等成分可以通过胎盘进入胎儿体内，干扰胎儿的心脏发育。研究显示，孕妇酗酒的程度越严重，胎儿患先天性心脏病的可能性越大，可能出现心脏结构的多种异常。在年龄方面，年轻孕妇如果有酗酒的不良生活习惯，对胎儿心脏发育的影响可能更为显著。对于孕期女性，应避免酗酒等不良生活习惯，保持健康的生活方式。例如，在备孕前就应戒烟戒酒，孕期严格遵守健康的生活准则，以保障胎儿心脏的正常发育。
4.孕期母亲患有某些疾病：母亲孕期患有糖尿病等代谢性疾病也与复杂性先天性心脏病的发生相关。患有糖尿病的孕妇，其体内高血糖环境会影响胎儿的代谢，导致心脏发育过程中出现异常。研究表明，糖尿病孕妇所生婴儿患先天性心脏病的概率比正常孕妇高。在不同年龄的母亲中，孕期患有糖尿病对胎儿心脏发育的影响是相似的机制，但年轻糖尿病孕妇可能因为自身代谢控制情况等因素对胎儿影响有所不同。对于孕期患有糖尿病的母亲，需要严格控制血糖水平，通过合理的饮食、运动等方式（在医生指导下）来保障胎儿的正常发育，降低胎儿患复杂性先天性心脏病的风险。
