肾萎缩的病因包括先天性和后天性因素。先天性因素主要是肾发育不良，与胚胎发育时肾脏分化生长异常及遗传因素有关，多见于儿童。后天性因素有缺血性因素（如肾动脉狭窄、休克）、梗阻性因素（如尿路结石、前列腺增生）、感染性因素（如慢性肾盂肾炎）、自身免疫性疾病（如系统性红斑狼疮性肾炎）、代谢性因素（如糖尿病肾病），不同病因在年龄、性别等方面各有特点。
一、先天性因素
（一）肾发育不良
1.发生机制：在胚胎发育过程中，肾脏的正常分化、生长出现异常，导致肾脏体积较正常明显缩小，功能也会受到不同程度的影响。这种情况可能与遗传因素有关，部分患儿存在特定基因的突变或异常，使得肾脏在胚胎期的发育程序出现紊乱。例如某些单基因遗传病可能会导致肾发育不良相关的基因表达或功能异常，从而引发肾萎缩。
2.年龄因素：主要见于儿童群体，在新生儿期或婴幼儿期通过超声等检查可能发现肾萎缩情况，与胚胎发育阶段的异常密切相关。
二、后天性因素
（一）缺血性因素
1.肾动脉狭窄
发生机制：肾动脉主干或分支发生狭窄，导致肾脏血液灌注不足。常见原因包括动脉粥样硬化，多见于中老年人，动脉壁脂质沉积、内膜增厚，逐渐引起管腔狭窄；也可见于多发性大动脉炎，青年女性相对多见，炎症累及肾动脉，造成血管狭窄或闭塞，使肾脏长期处于缺血状态，进而导致肾组织萎缩。
年龄、性别等因素：动脉粥样硬化导致的肾动脉狭窄多见于中老年人，男性和女性均可发病，但随着年龄增长，发病风险增加；多发性大动脉炎好发于青年女性。
2.休克
发生机制：严重的休克状态，如失血性休克、感染性休克等，会使肾脏灌注压急剧下降，肾血流量减少，引起急性肾小管坏死等肾损伤，长期反复的严重休克可导致肾萎缩。例如大量失血后，肾脏缺血缺氧，肾组织细胞受损，若未得到及时有效的纠正，肾脏逐渐出现萎缩。
年龄因素：各年龄段均可发生，但对于儿童来说，严重感染等原因导致的休克若未及时处理，也可能影响肾脏发育及功能，导致肾萎缩；老年人由于本身肾功能储备下降，更容易在休克后出现肾损伤进而发展为肾萎缩。
（二）梗阻性因素
1.尿路结石
发生机制：肾盂、输尿管等部位的结石可引起尿路梗阻，导致尿液排出受阻，肾盂内压力升高，进而影响肾实质的血液供应和尿液引流，长期梗阻可造成肾积水，压迫肾实质，引起肾萎缩。例如输尿管结石堵塞输尿管，使上方尿液积聚，肾脏逐渐积水扩张，肾实质受压变薄，功能减退。
年龄、性别因素：尿路结石在各个年龄段都可能发生，男性相对多于女性，可能与男性的生理结构等因素有关，且随着年龄增长，尿路结石的发生率有上升趋势，老年人由于代谢等原因更容易形成结石导致梗阻。
2.前列腺增生
发生机制：多见于老年男性，前列腺增生导致尿道梗阻，引起膀胱出口梗阻，进而造成双肾积水，长期肾积水可使肾实质受压萎缩。前列腺增生使尿道变窄，排尿阻力增加，膀胱内尿液排空不畅，尿液逆流至肾盂，引起肾盂扩张积水，压迫肾实质，影响肾脏功能，逐渐出现肾萎缩。
年龄、性别因素：主要发生于老年男性，随着年龄增长，前列腺增生的发生率明显升高，是导致老年男性肾萎缩的常见原因之一。
（三）感染性因素
1.慢性肾盂肾炎
发生机制：由细菌等病原体反复感染肾脏，引起肾盂、肾间质的慢性炎症，导致肾组织纤维化，肾脏体积缩小。病原体持续感染肾脏，引发炎症反应，炎症破坏肾组织，纤维组织增生替代正常肾组织，使得肾脏逐渐萎缩。例如大肠杆菌等致病菌反复感染肾盂，造成肾间质的慢性炎症损伤。
年龄、性别因素：各年龄段均可发病，女性由于尿道短等生理特点，更容易发生泌尿系统感染，若反复发作慢性肾盂肾炎，更易导致肾萎缩；儿童时期反复的肾盂肾炎若未有效控制，也可能影响肾脏发育，导致肾萎缩。
（四）自身免疫性疾病
1.系统性红斑狼疮性肾炎
发生机制：系统性红斑狼疮是一种自身免疫性疾病，当累及肾脏时，产生的自身抗体攻击肾脏组织，引起肾小球、肾小管等病变，长期的炎症损伤可导致肾萎缩。自身抗体与肾脏抗原结合形成免疫复合物，沉积在肾脏不同部位，激活炎症细胞，释放炎症介质，损伤肾组织，随着病情进展，肾组织逐渐纤维化，肾脏体积缩小。
年龄、性别因素：多见于育龄期女性，女性发病率明显高于男性，发病年龄可在青少年至老年，但以育龄期多见，由于自身免疫紊乱在女性中相对更易发生，且激素水平等因素影响，使得系统性红斑狼疮性肾炎在女性中的发生率较高，进而更容易导致肾萎缩。
（五）代谢性因素
1.糖尿病肾病
发生机制：糖尿病患者长期血糖控制不佳，可引起肾脏微血管病变，肾小球硬化，肾小管-间质纤维化，最终导致肾萎缩。高血糖状态下，肾脏微血管内皮细胞受损，基底膜增厚，肾小球滤过膜功能异常，蛋白质等物质漏出增加，同时肾间质纤维化使肾脏结构破坏，肾脏体积逐渐缩小。
年龄、性别因素：各年龄段的糖尿病患者均可能发生糖尿病肾病，若糖尿病病程较长且血糖控制不理想，发生肾萎缩的风险增加；男性和女性糖尿病患者均可发生，但随着糖尿病病程延长，肾萎缩的发生率在糖尿病患者中逐渐上升，且没有明显的性别差异，但女性糖尿病患者可能在激素等因素影响下，肾脏病变的进展可能有一定特点。
