子宫发育不良受遗传、内分泌、胚胎时期发育异常及其他因素影响。遗传因素中染色体异常等可干扰子宫胚胎期分化形成；内分泌因素包含性激素水平异常及下丘脑-垂体-卵巢轴功能紊乱，前者因性激素分泌不足或失调影响，后者因轴功能紊乱致性激素调节异常；胚胎时期发育异常与妊娠早期母体感染病毒、接触有害物质等有关；其他因素里营养不足会因缺乏营养影响子宫发育，某些全身性疾病如甲状腺功能减退症、自身免疫性疾病等也间接影响子宫发育。
内分泌因素
1.性激素水平异常：在女性的生长发育过程中，性激素起着至关重要的调节作用。雌激素和孕激素是影响子宫发育的主要性激素。如果在胚胎时期或出生后的生长发育阶段，体内雌激素、孕激素等性激素分泌不足或比例失调，就会影响子宫的正常发育。例如，垂体分泌促性腺激素异常，导致卵巢分泌的性激素减少，进而使子宫得不到足够的性激素刺激来完成正常的生长发育过程。不同年龄阶段的女性，内分泌状态不同，青春期前内分泌尚未完全建立，青春期时内分泌逐渐完善，育龄期内分泌相对稳定，绝经后内分泌发生明显变化，在这些不同阶段内分泌的异常对子宫发育的影响机制和表现有所不同。
2.下丘脑-垂体-卵巢轴功能紊乱：下丘脑分泌促性腺激素释放激素，垂体分泌促性腺激素，它们与卵巢相互作用形成下丘脑-垂体-卵巢轴，共同调节女性的生殖内分泌功能。如果这个轴的功能出现紊乱，比如下丘脑分泌激素的节律异常、垂体对促性腺激素释放激素的反应异常、卵巢对促性腺激素的反应异常等，都会影响性激素的正常分泌和调节，从而干扰子宫的发育。生活方式因素如长期熬夜、精神压力过大等可能会影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，增加子宫发育不良的风险，尤其是对于处于生长发育关键时期的青少年女性来说，不良生活方式对内分泌的干扰更为明显。
胚胎时期发育异常
在胚胎发育的关键时期，如妊娠早期，受到各种不利因素的影响可能导致子宫发育异常。例如，母体在妊娠早期感染某些病毒，如风疹病毒等，病毒可能通过胎盘影响胚胎的正常发育，包括子宫的发育。孕妇在妊娠早期接触某些有害物质，如化学毒物、放射性物质等，也可能干扰胚胎的正常分化和组织器官的形成，其中就包括子宫的发育。不同孕周胚胎发育的敏感时期不同，妊娠早期是器官形成的关键阶段，此时期的不良因素影响子宫发育的可能性更大，而对于有过胚胎发育异常妊娠史的女性，再次妊娠时子宫发育不良的风险可能相对增加。
其他因素
1.营养因素：在生长发育过程中，充足且均衡的营养供应是非常重要的。如果在胎儿时期或出生后的生长发育阶段，母体营养不良或儿童自身营养不良，缺乏蛋白质、维生素、矿物质等重要营养物质，会影响身体各个器官的发育，包括子宫。例如，缺乏蛋白质会影响细胞的增殖和组织的构建，从而影响子宫的正常生长发育。不同年龄段对营养的需求不同，儿童期和青春期是身体快速生长发育的时期，对营养的需求更高，此阶段营养不足对子宫发育的影响更为显著。
2.疾病因素：某些全身性疾病也可能间接影响子宫发育。例如，患有甲状腺功能减退症，甲状腺激素分泌不足会影响机体的新陈代谢和生长发育，包括生殖系统的发育，进而可能导致子宫发育不良。还有一些自身免疫性疾病，机体的自身免疫反应可能攻击生殖系统相关组织，影响子宫的正常发育。对于患有基础疾病的人群，如患有内分泌疾病、自身免疫性疾病等，需要积极治疗基础疾病，以降低对子宫发育的不良影响，尤其是女性患者在备孕或孕期更要关注基础疾病对子宫及胎儿发育的影响。
