肛周脓肿手术费用受医院等级、病情严重程度、手术方式、地区经济水平影响，大致范围在几千元到上万元不等。
1.医院等级
一般来说，基层医院的收费相对较低。例如，在一些县级医院进行单纯的肛周脓肿切开引流手术，费用可能在3000-5000元。这是因为基层医院的设备、人力成本等相对较低，且医疗服务定价相对保守。而在三甲医院，由于其医疗技术水平、设备先进程度等因素，手术费用会相对高一些。单纯的肛周脓肿切开引流手术费用可能在5000-8000元甚至更高。三甲医院拥有更精良的检查设备来准确诊断病情，手术中使用的一次性耗材等成本也较高，同时医生的技术水平和经验带来的医疗服务价值也体现在费用中。
2.病情严重程度
如果是单纯的、病情相对较轻的肛周脓肿，手术相对简单，费用相对较低。比如脓肿范围较小，未累及复杂解剖结构的情况，手术费用可能在4000-6000元。因为手术操作相对容易，耗时短，使用的医疗资源相对较少。对于复杂性肛周脓肿，如脓肿范围大、涉及多个间隙或者伴有其他复杂情况的肛周脓肿，手术难度增加，需要更精细的操作、更长的手术时间，并且可能需要使用更高级的医疗设备辅助等，费用会明显升高，可能在8000元以上，甚至可达1万元及以上。因为需要更多的医疗耗材、更复杂的手术方案设计以及更专业的医护人员精力投入等。
3.手术方式因素
传统的肛周脓肿切开引流术相对费用较低，如前面所说基层医院可能3000-5000元，三甲医院可能5000-7000元。这种手术方式是直接切开脓肿引流，操作相对常规。而肛周脓肿一次性根治术，由于手术过程相对复杂，需要更精准地处理肛瘘内口等情况，费用会比传统切开引流术高。一般在基层医院可能6000-8000元，三甲医院可能8000元以上，甚至过万。因为这种手术需要更精细的操作来避免复发，对手术医生的技术要求更高，使用的医疗材料等成本也有所不同。
4.地区经济水平
在经济欠发达地区，整体的医疗服务定价相对较低，肛周脓肿手术费用也会相应较低。例如在一些经济欠发达的县级地区，单纯肛周脓肿切开引流手术可能在2000-4000元。这是因为当地的物价水平、医院运营成本等综合因素决定的。在经济发达地区，如一线城市的三甲医院，肛周脓肿手术费用会明显偏高。单纯的肛周脓肿切开引流手术可能在7000-1万元甚至更高。因为发达地区的人力成本、医疗设备更新成本等都较高，导致手术费用上升。
特殊人群方面，对于儿童患者，由于其身体机能和成人不同，在肛周脓肿手术时更要谨慎选择手术时机和手术方式，以减少对儿童生长发育的影响。
