阴茎短小受遗传、内分泌、发育、肥胖、生活方式、疾病等多种因素影响，遗传因素使家族有阴茎短小史者概率高，内分泌中雄激素等异常会影响，胚胎发育异常、尿道下裂等畸形可致，肥胖致雌激素对抗雄激素，不良生活方式如饮食、运动、吸烟饮酒有影响，睾丸、垂体、肾脏等疾病也会导致，儿童或成年男性有相关情况应就医，保持健康生活方式可降低风险。
内分泌因素
1.雄激素水平：雄激素对阴茎的发育起着关键作用。在胎儿时期，雄激素促使阴茎正常发育；在青春期，雄激素水平的变化会进一步影响阴茎的生长。如果体内雄激素分泌不足，会影响阴茎海绵体的发育，导致阴茎短小。例如，先天性肾上腺皮质增生症等疾病可能会影响雄激素的合成，从而影响阴茎发育。青春期前垂体功能减退等情况也会导致雄激素分泌减少，进而影响阴茎的正常生长。
2.其他内分泌激素：除雄激素外，生长激素等其他内分泌激素也与阴茎发育有关。生长激素可以促进身体的生长发育，包括生殖器官的发育。如果生长激素分泌异常，也可能间接影响阴茎的发育，导致阴茎短小。
发育异常
1.胚胎发育时期的异常：在胚胎发育过程中，如果出现异常情况，可能会影响阴茎的正常形成。例如，母亲在妊娠期间受到某些不良因素影响，如感染某些病毒（如风疹病毒等）、接触有害化学物质、受到放射性辐射等，可能干扰胎儿阴茎的正常发育，导致出生后阴茎短小。
2.尿道下裂等畸形伴随的阴茎短小：尿道下裂是一种常见的男性尿道畸形，往往同时伴有阴茎发育不良，表现为阴茎短小且向腹侧弯曲等。这是因为在胚胎发育过程中尿道沟融合等环节出现异常，进而影响了阴茎的正常形态和大小发育。
肥胖因素
肥胖人群中，过多的脂肪会堆积在腹部等部位，体内的雌激素会增多。雌激素有对抗雄激素的作用，会影响雄激素对阴茎发育的促进作用，从而可能导致阴茎相对短小。例如，有研究发现，肥胖男性中出现阴茎短小的比例相对高于正常体重男性。
生活方式因素
1.不良的饮食习惯：长期营养不良，缺乏蛋白质、维生素等营养物质，会影响身体的正常生长发育，包括生殖器官的发育。例如，长期素食且营养搭配不均衡的人群，可能会因为营养摄入不足而影响阴茎的正常发育，导致阴茎短小。
2.缺乏运动：缺乏运动可能导致身体代谢功能下降，影响内分泌系统的正常调节，进而影响阴茎的发育。运动不足会使身体处于一种相对慵懒的状态，不利于激素的正常分泌和运输等，从而可能对阴茎发育产生不利影响。
3.吸烟饮酒：吸烟产生的尼古丁等有害物质以及过量饮酒会影响血液循环和内分泌功能。吸烟会导致血管收缩，减少阴茎海绵体的血液供应，影响阴茎的正常发育；过量饮酒会干扰肝脏等器官对激素的代谢等功能，间接影响阴茎发育，增加阴茎短小的风险。
疾病因素
1.睾丸疾病：如睾丸发育不良、无睾症等，会直接影响雄激素的分泌和产生，从而导致阴茎短小。睾丸是产生雄激素的主要场所，睾丸出现病变会使雄激素水平大幅下降，进而影响阴茎的正常生长发育。
2.垂体疾病：垂体是内分泌系统的重要器官，垂体肿瘤等疾病可能会影响生长激素、促性腺激素等的分泌，从而影响阴茎发育，导致阴茎短小。例如，垂体瘤可能会压迫相关内分泌细胞，使激素分泌异常，进而影响生殖器官的发育。
3.肾脏疾病：严重的肾脏疾病可能会影响身体的代谢和内分泌平衡。肾脏功能受损会影响激素的代谢、排泄等过程，间接影响阴茎的发育，导致阴茎短小。例如，慢性肾衰竭患者可能会出现内分泌紊乱等情况，从而影响生殖器官的正常发育。
对于儿童来说，家长要关注孩子的生长发育情况，若发现阴茎发育明显异于同龄人，应及时就医检查。对于成年男性，若发现阴茎短小影响生活质量等，也应及时到正规医院就诊，明确原因后进行相应处理。同时，保持健康的生活方式，如合理饮食、适量运动、戒烟限酒等，有助于维持正常的内分泌和身体发育状态，降低阴茎短小的发生风险。
