三叉神经痛的发生与多种因素有关，包括血管压迫因素（如约80%-90%的原发性三叉神经痛与颅内走行血管异常袢状压迫三叉神经根部有关，中老年人因血管变化更常见）、神经损伤因素（手术损伤、面部外伤及病毒感染如带状疱疹病毒感染可引发）、中枢神经系统病变因素（多发性硬化致中枢神经系统髓鞘脱失影响传导，桥小脑角区肿瘤压迫三叉神经）、其他因素（存在遗传易感性，长期精神心理因素如紧张焦虑抑郁可诱发或加重，女性在精神心理因素影响下相对更易受影响但男性也可能出现）。
颅内走行的血管与三叉神经相互毗邻，如小脑上动脉、小脑前下动脉等血管的异常袢状压迫三叉神经根部，是导致原发性三叉神经痛的常见原因之一。研究发现，约80%-90%的原发性三叉神经痛与血管压迫有关。血管长期压迫会使三叉神经的神经纤维受到机械性刺激，导致神经脱髓鞘改变，使得神经纤维之间的电信号发生短路，从而引发异常的神经冲动，进而出现三叉神经痛的发作。这种情况在中老年人中相对较为常见，可能与随着年龄增长血管发生一定程度的迂曲、硬化等变化有关。
神经损伤因素
手术损伤
面部或颅内的一些手术操作，如三叉神经感觉根切断术等，如果手术过程中对三叉神经造成了损伤，可能会引发继发性三叉神经痛。另外，面部的外伤导致三叉神经受到直接的撞击、牵拉等损伤，也有可能引起三叉神经痛。例如，面部严重的车祸伤等可能导致三叉神经受损，从而出现疼痛症状。
病毒感染
某些病毒感染可能会累及三叉神经，引发炎症反应，导致三叉神经痛。如带状疱疹病毒感染，当病毒侵犯三叉神经节时，可引起神经的炎症、水肿等改变，从而诱发三叉神经痛。有研究表明，在带状疱疹后发生三叉神经痛的病例并不少见，尤其是中老年人在感染带状疱疹后，发生继发性三叉神经痛的风险相对增加。
中枢神经系统病变因素
多发性硬化
这是一种中枢神经系统的自身免疫性疾病，病变可累及三叉神经的感觉传导通路。多发性硬化会导致中枢神经系统内的髓鞘脱失，影响神经信号的正常传导，使得三叉神经的感觉传入出现异常，从而引发三叉神经痛。在患有多发性硬化的患者中，部分会出现三叉神经痛的症状，且女性患者相对更易受到影响，可能与女性的免疫相关机制特点有关。
肿瘤病变
颅内的一些肿瘤，如桥小脑角区的肿瘤（如听神经瘤、脑膜瘤等），当肿瘤生长到一定程度时，会压迫三叉神经，导致神经受压、缺血等改变，进而引起三叉神经痛。肿瘤引起的三叉神经痛通常是继发性的，随着肿瘤的增大，疼痛可能会逐渐加重，并且可能还会伴有其他神经系统症状，如面部麻木、听力下降等。不同年龄段都可能发生肿瘤相关的三叉神经痛，但中老年人相对更常见，因为肿瘤的发生发展通常有一个过程。
其他因素
遗传因素
有研究发现，三叉神经痛可能存在一定的遗传易感性。某些家族中可能存在特定的基因变异，使得家族成员患三叉神经痛的风险相对高于普通人群。不过，目前关于三叉神经痛的遗传机制还不是完全明确，需要进一步深入研究来揭示具体的遗传关联情况。
精神心理因素
长期的精神紧张、焦虑、抑郁等不良情绪状态可能会诱发或加重三叉神经痛。精神心理因素可能通过影响神经系统的调节功能，使得人体对疼痛的敏感性增加。例如，一些长期处于高压工作状态的人群，由于精神长期处于紧张状态，更容易出现三叉神经痛的发作或者使原本的疼痛症状加重。女性在情绪管理方面相对男性可能更易受外界因素影响，所以在精神心理因素导致的三叉神经痛中，女性可能相对更易受到影响，但这也不是绝对的，男性在长期精神压力下也可能出现相关情况。
