肛瘘内口自愈需机体自身免疫状态良好、内口感染程度较轻、局部卫生状况良好及基础健康状况良好。机体免疫良好时，不同年龄性别有差异；内口感染轻时，范围深度及病原体毒力有影响；局部卫生好能减少刺激；无影响愈合基础病且营养佳利于自愈。
一、机体自身免疫状态良好
对于不同年龄人群：儿童免疫系统尚在发育中，若本身营养状况良好、无基础免疫缺陷疾病，如先天性免疫球蛋白缺乏等情况，相对更有可能凭借自身免疫机制促使肛瘘内口自愈。而成年人免疫系统相对稳定，若没有患有像艾滋病等严重影响免疫功能的疾病，自身免疫能够较好地发挥作用，识别和清除感染病灶相关因素，为内口自愈创造条件。例如，一项针对不同年龄段肛瘘患者的研究发现，免疫功能正常的成年人中，部分肛瘘内口有自愈倾向的比例相对高于免疫功能低下人群。
对于不同性别：一般来说，在没有特殊基础疾病影响免疫的情况下，性别本身对肛瘘内口自愈的影响并不显著，但女性在特殊生理时期，如孕期，若出现肛瘘，自身免疫状态会受到一定影响，相对可能较难单纯依靠自身免疫让内口自愈，需要综合其他因素考虑；男性若没有基础免疫相关疾病，自身免疫状态对肛瘘内口自愈的影响主要体现在能否有效应对感染源等方面。
二、肛瘘内口感染程度较轻
感染范围与深度：如果肛瘘内口的感染范围比较局限，没有广泛扩散累及周围较多组织，且感染深度较浅，没有深入到重要的肌肉层等深层结构。比如感染仅局限在黏膜层附近，未向deeper组织侵袭，那么机体自身的修复机制更容易发挥作用，促使内口愈合。临床观察发现，感染范围小、深度浅的肛瘘患者，内口自愈的概率相对更高。
感染病原体毒力：若引起肛瘘内口感染的病原体毒力较弱，例如是一些致病性相对不强的普通细菌感染，而非毒力很强的耐药菌等感染。这样机体的免疫系统能够相对容易地抑制病原体的生长繁殖，减少对组织的破坏，为内口自愈提供有利环境。有研究表明，由毒力较弱病原体引起的肛瘘内口，相比毒力强的病原体感染的内口，更有自愈的可能。
三、局部卫生状况良好
日常清洁：患者能够保持肛瘘部位的清洁，经常进行局部清洗，减少细菌等病原体在局部的定植。无论是儿童还是成年人，都需要注意保持肛周清洁。儿童由于活动后容易弄脏肛周，家长要帮助其做好局部清洁，避免粪便等污染物残留刺激肛瘘内口，影响愈合；成年人则要养成良好的卫生习惯，每天用温水清洗肛周，勤换内裤等。良好的局部卫生环境有助于创造不利于病原体生长的条件，促进内口自愈。例如，保持肛周清洁的肛瘘患者内口愈合情况相对更好。
避免局部刺激：要避免局部受到搔抓、摩擦等刺激，无论是儿童玩耍时无意的搔抓还是成年人久坐等导致肛周局部摩擦，都可能加重肛瘘内口的损伤，不利于自愈。儿童应穿着宽松舒适的衣物，避免肛周受到摩擦；成年人要避免长时间久坐，选择合适的坐垫等，减少局部刺激因素，为内口自愈营造良好的局部环境。
四、基础健康状况良好
无影响愈合的基础疾病：患者没有像糖尿病等会影响伤口愈合的基础疾病。糖尿病患者由于血糖水平升高，会影响白细胞的功能等，不利于组织的修复，肛瘘内口自愈相对困难。对于患有糖尿病的肛瘘患者，若要促进内口自愈，需要在控制血糖的基础上综合其他措施。而没有此类基础疾病的患者，自身组织修复能力能够较好地发挥作用，有助于肛瘘内口自愈。例如，糖尿病患者肛瘘内口自愈率明显低于非糖尿病患者。
营养状况良好：充足的营养摄入对于肛瘘内口自愈至关重要。儿童处于生长发育阶段，需要保证蛋白质、维生素等营养物质的充足供应，如摄入富含蛋白质的肉类、蛋类，富含维生素的蔬菜水果等，以促进组织修复；成年人也需要维持良好的营养状态，均衡饮食，保证身体有足够的营养物质来支持内口的愈合过程。研究显示，营养状况良好的肛瘘患者内口自愈的可能性相对较高。
