卵巢囊肿的成因包括生理性因素（卵泡囊肿、黄体囊肿）、病理性因素（子宫内膜异位囊肿、卵巢浆液性囊腺瘤、卵巢黏液性囊腺瘤、卵巢畸胎瘤、卵巢转移性肿瘤）以及其他因素（内分泌因素、遗传因素、生活方式因素），生理性因素多与月经周期等相关，病理性因素各有其发病机制，其他因素通过不同途径影响卵巢健康从而诱发囊肿。
一、生理性因素
1.卵泡囊肿
女性的卵巢每月会有卵泡发育、成熟及排卵过程。在卵泡发育过程中，如果卵泡没有正常破裂排卵，持续增大就会形成卵泡囊肿。一般多见于生育年龄的女性，通常与正常的月经周期中卵泡的发育和排卵异常相关，多数可在几个月经周期内自行消失。例如，正常情况下卵泡发育到一定大小后会破裂排卵，如果因为内分泌等因素影响，卵泡持续生长，就可能形成卵泡囊肿。
2.黄体囊肿
排卵后卵泡壁会形成黄体，正常黄体直径一般在2-3cm，如果黄体持续增大，直径超过3cm就成为黄体囊肿。怀孕早期的女性也可能出现黄体囊肿，这与妊娠后体内激素变化有关，妊娠黄体可形成黄体囊肿，一般在妊娠3个月后可自行消退。对于非孕期女性，黄体囊肿的形成可能与黄体期激素水平波动等因素有关，部分黄体囊肿可能会引起腹痛等症状。
二、病理性因素
1.子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）
子宫内膜组织出现在卵巢上，随着月经周期反复出血，形成囊肿，囊肿内含有类似巧克力样的陈旧血性液体。这种情况多见于育龄期女性，与子宫内膜异位症的发病机制相关，子宫内膜组织可以通过经血逆流等途径种植到卵巢等部位。有子宫内膜异位症病史的女性发生卵巢囊肿的风险相对较高，并且可能会影响生育功能，导致痛经进行性加重等表现。
2.卵巢浆液性囊腺瘤
属于卵巢上皮性肿瘤的一种，是常见的卵巢良性肿瘤。其病因可能与卵巢上皮细胞的异常增殖有关，具体机制尚不完全明确，但一般认为与遗传因素、内分泌因素等有关。好发于生育年龄女性，肿瘤多为单侧，大小不一，囊内充满清亮液体。
3.卵巢黏液性囊腺瘤
也是卵巢上皮性肿瘤的一种，同样与卵巢上皮细胞的异常变化相关。多为单侧，体积往往较大，囊内含有黏稠的黏液。其发生可能与卵巢上皮细胞的分泌功能异常等因素有关，多见于生育年龄女性，有一定恶变可能。
4.卵巢畸胎瘤
来源于生殖细胞，肿瘤内可能含有毛发、牙齿、油脂等多种组织成分。其病因主要是生殖细胞异常分化，具体诱因尚不十分清楚，但在各个年龄段女性均可发生，包括儿童和青少年。成熟型畸胎瘤多为良性，未成熟型畸胎瘤有恶性倾向。
5.卵巢转移性肿瘤
由身体其他部位的原发肿瘤转移至卵巢所致，例如胃肠道、乳腺等部位的肿瘤可转移到卵巢。其病因主要是原发肿瘤细胞通过血液、淋巴等途径转移到卵巢，常见于中年以上女性，有其他部位恶性肿瘤病史的女性需要警惕卵巢转移瘤的可能。
三、其他因素
1.内分泌因素
长期的内分泌失调可能会诱发卵巢囊肿。例如，体内雌激素水平过高可能会刺激卵巢组织异常增生。育龄期女性如果长期处于精神压力大、生活不规律等状态，容易引起内分泌紊乱，进而增加卵巢囊肿的发生风险。比如，长期熬夜、过度劳累的女性，内分泌调节失衡，可能影响卵巢的正常功能，导致卵巢囊肿形成。
2.遗传因素
部分卵巢囊肿的发生与遗传有关。例如，某些遗传性综合征可能增加卵巢囊肿的发病风险，如遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征等。有家族中有相关遗传病史的女性，其发生卵巢囊肿的遗传易感性增加，需要更加密切地进行卵巢相关检查，以便早期发现和处理。
3.生活方式因素
不健康的生活方式也可能与卵巢囊肿的发生有关。长期吸烟、酗酒的女性，其身体的内环境容易发生改变，影响卵巢的正常生理功能，从而增加卵巢囊肿的发病几率。另外，缺乏运动、高脂肪饮食等生活方式也可能对卵巢健康产生不利影响，进而与卵巢囊肿的发生相关。例如，高脂肪饮食可能会影响激素代谢，导致内分泌紊乱，增加卵巢囊肿的发生风险。
