卵巢囊肿的成因包括生理性因素（卵泡囊肿、黄体囊肿）、病理性因素（子宫内膜异位囊肿、浆液性囊腺瘤、粘液性囊腺瘤、卵巢冠囊肿、卵巢转移性肿瘤）以及其他因素（遗传、生活方式、环境），生理性因素中卵泡囊肿是未正常排卵致卵泡持续存在形成，黄体囊肿是黄体血肿未及时吸收形成；病理性因素里不同囊肿成因各有特点；其他因素中遗传、不良生活方式、环境等均会影响卵巢囊肿发生风险。
一、生理性因素
（一）卵泡囊肿
1.发生机制：正常情况下，卵巢内的卵泡会随着月经周期发生发育、成熟及排卵等过程。当卵泡生长到一定大小但没有正常排卵时，卵泡持续存在就可能形成卵泡囊肿。一般在育龄女性的月经周期中较为常见，通常直径多在2-3厘米左右，多数情况下会在几个月经周期内自行消失，这与女性正常的内分泌调节和卵泡发育的生理过程相关，女性体内激素水平的变化会影响卵泡的正常排出等环节。
（二）黄体囊肿
1.发生机制：排卵后卵泡壁会塌陷形成黄体，黄体在正常情况下会随着月经周期的进展逐渐退化。但如果黄体血肿没有及时吸收，就会形成黄体囊肿。部分女性在月经后半期可能出现这种情况，一般直径一般在3-5厘米左右，有的也可自行消退，这与黄体形成后的正常转归过程以及是否出现血肿等情况有关，受女性体内孕激素等激素水平变化的影响。
二、病理性因素
（一）子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）
1.发生机制：子宫内膜组织出现在卵巢上，随着月经周期反复出血，形成囊肿，囊肿内含有类似巧克力样的暗褐色粘稠液体。这种情况多见于育龄女性，与子宫内膜异位症的发病机制相关，子宫内膜组织可能通过经血逆流等途径种植到卵巢等部位，女性的生育状况、月经情况等都可能影响其发生风险，比如未生育的女性相对发生子宫内膜异位囊肿的风险可能较高一些，因为生育过程可能对子宫内膜异位症有一定的预防作用。
（二）浆液性囊腺瘤
1.发生机制：是一种常见的卵巢上皮性肿瘤，可能与卵巢上皮细胞的异常增生有关。其具体的发病原因尚不完全明确，但可能涉及到细胞的基因突变等因素，可发生于不同年龄段的女性，一般为单侧多见，囊内为清澈浆液。
（三）粘液性囊腺瘤
1.发生机制：也是卵巢上皮性肿瘤的一种，由卵巢表面上皮向粘液细胞分化而来，肿瘤细胞分泌粘液，使囊内充满粘液样物质，同样发病机制与上皮细胞的异常增殖等有关，可发生在不同年龄阶段的女性，多为单侧，体积往往较大。
（四）卵巢冠囊肿
1.发生机制：起源于中肾管或副中肾管遗迹，是一种良性囊肿，其发生与胚胎发育过程中遗留的组织有关，一般体积较小，多无明显症状，可发生于不同年龄段女性。
（五）卵巢转移性肿瘤
1.发生机制：由身体其他部位的恶性肿瘤转移至卵巢所致，例如胃肠道、乳腺等部位的恶性肿瘤都可能转移到卵巢形成转移性囊肿。这种情况多见于有其他部位恶性肿瘤病史的女性，肿瘤细胞通过血液转移、淋巴转移等途径到达卵巢，从而形成囊肿。
三、其他因素
（一）遗传因素
1.影响情况：某些遗传性疾病可能增加卵巢囊肿的发生风险，比如遗传性乳腺癌-卵巢癌综合征等，有相关家族遗传史的女性，其基因携带突变的可能性较高，进而使得卵巢发生囊肿的概率相对增加。
（二）生活方式因素
1.影响情况：长期的不良生活方式可能对卵巢囊肿的发生有一定影响。例如长期熬夜、精神压力过大等，可能会扰乱女性的内分泌系统，导致激素水平失衡，从而影响卵巢的正常功能，增加卵巢囊肿的发生风险。另外，过度肥胖的女性，体内脂肪代谢等可能出现异常，也可能与卵巢囊肿的发生有一定关联，因为脂肪组织可以分泌一些激素样物质，影响内分泌环境。
（三）环境因素
1.影响情况：长期接触一些环境中的有害物质，如某些化学污染物等，可能会对卵巢组织产生不良影响，增加卵巢囊肿的发生几率。此外，长期处于不良的生活环境中，如空气污染严重等，也可能通过影响女性整体健康状况，间接影响卵巢功能，进而与卵巢囊肿的发生相关。
