可通过症状表现、体格检查、影像学检查来判断肛周脓肿深浅，浅表肛周脓肿疼痛局限、肿胀范围小，肛门指检可触及表浅硬结肿块，超声可见皮下低或无回声区、MRI能清显示皮下病灶；深部肛周脓肿疼痛复杂且放射、肿胀范围广，肛门指检可触及深部较大硬块且波动感不明显、直肠腔内超声可助判断，超声能发现深部间隙液性暗区、MRI能全面显示深部间隙脓肿及与周围结构关系，不同人群判断原则一致，生活方式因素不影响判断方法。
一、通过症状表现初步判断
（一）浅表肛周脓肿
疼痛方面：浅表肛周脓肿疼痛相对较局限，多为肛周局部的胀痛，疼痛程度相对表浅脓肿患者能较明确指出疼痛位置，一般在肛门周围皮下，疼痛性质相对较尖锐，在排便、行走等动作时可能会刺激到病变部位，疼痛有较明显的局部定位感。例如，患者可感觉到肛门周围某一特定区域的刺痛或跳痛，且疼痛在静止时可能稍轻，活动或受压时加重。
肿胀情况：肿胀范围相对比较局限，一般在肛门周围皮下能触及较局限的肿块，肿块边界相对清楚，用手触摸时可感觉到皮下有较硬的包块，肿胀程度相对较轻，外观上可能可见肛门周围某一小区域稍有隆起，皮肤颜色可能稍有发红，但发红范围不大。
（二）深部肛周脓肿
疼痛方面：深部肛周脓肿疼痛往往更为复杂，疼痛可能向会阴、骶尾部等部位放射，疼痛程度可能更剧烈，且疼痛定位不如浅表脓肿那样明确，患者可能难以确切指出疼痛的最准确位置，常表现为较为弥漫的深部坠痛，在行走、坐立等时都可能受到明显影响，有时患者会感觉整个会阴部都有坠胀不适且伴有疼痛，疼痛持续时间较长，休息时也可能难以缓解。
肿胀情况：深部肛周脓肿肿胀范围较广，可涉及肛周间隙的深部，外观上可能可见肛门周围相应区域有较广泛的隆起，皮肤发红范围相对较大，用手触摸时可能触及深部较广泛的组织增厚或肿块，且肿块边界不清，肿胀程度相对较重，可能会影响到患者的坐姿、行走等活动，因为深部组织的肿胀会对周围结构产生较明显的压迫。
二、通过体格检查来判断
（一）浅表肛周脓肿
医生进行肛门指检时，可在肛门周围皮下触及硬结或肿块，质地相对较韧，有压痛，肿块位置表浅，一般距离肛门皮肤较近，通过指检能较明确地触摸到皮下的病变组织，且病变范围相对容易确定，手指触摸时能感觉到局部组织的异常增厚区域比较局限。
（二）深部肛周脓肿
肛门指检时可发现深部有较大的肿块，质地较硬，压痛明显，肿块位置较深，手指触摸时能感觉到病变累及deeper的肛周间隙组织，可能触及到肛门括约肌间隙等深部结构的异常，且病变范围较广，手指难以清晰界定其边界，有时还可能伴有波动感，但深部脓肿的波动感不如浅表脓肿那样明显易触及，因为深部组织的肿胀和炎症使得波动感传递不明显。同时，医生可能还会进行直肠腔内超声检查等进一步辅助判断，直肠腔内超声可以更清晰地显示深部肛周组织的病变情况，如脓肿的位置、大小、与周围组织的关系等，能发现浅表检查难以察觉的深部脓肿情况，显示出深部脓肿所在的间隙有液性暗区等异常表现。
三、借助影像学检查明确
（一）超声检查
浅表肛周脓肿：超声下可清晰看到肛门周围皮下的低回声或无回声区，边界相对清楚，能明确显示脓肿的大小、位置，位于皮下较表浅的层次，周围组织炎症反应相对局限在皮下组织层。
深部肛周脓肿：超声可发现深部肛周间隙内的异常液性暗区，病变累及的层次较深，如坐骨直肠窝脓肿等深部间隙的脓肿，超声能显示出脓肿占据深部间隙，范围较广，与周围深部组织如肛提肌等的关系清晰可见，能帮助医生准确判断脓肿的深度和范围。
（二）磁共振成像（MRI）检查
浅表肛周脓肿：MRI能清楚显示肛门周围皮下的脓肿病灶，表现为皮下的异常信号影，边界相对明确，可准确判断浅表脓肿的位置、大小，对于皮下脓肿的诊断和评估有很好的效果，能清晰呈现病变与周围皮肤、皮下组织的关系。
深部肛周脓肿：MRI对深部肛周脓肿的诊断价值更高，能全面显示深部肛周各个间隙的脓肿情况，如骨盆直肠间隙脓肿等深部间隙的病变，能清晰显示脓肿在深部间隙内的蔓延范围，与肛门括约肌、直肠等周围重要结构的关系，对于制定治疗方案具有重要的指导意义，因为它可以更精确地了解深部脓肿的复杂解剖关系，避免手术中损伤重要结构。
不同年龄、性别等因素在判断肛周脓肿深浅上并没有本质的差异，但在儿童患者中，由于儿童表述能力有限，可能需要更细致地通过体格检查和影像学检查来综合判断，因为儿童肛周脓肿的表现可能不如成人那样典型，需要借助更精准的检查手段来明确脓肿是深还是浅。而对于女性患者，在进行肛门指检和影像学检查时要注意操作的轻柔，避免引起不必要的不适，但判断原则与其他人群一致。生活方式方面，如长期久坐、不注意肛周卫生等人群更容易发生肛周脓肿，在判断脓肿深浅时，这些因素可能提示病变发生的背景，但不影响对脓肿深浅的判断方法本身，主要还是依靠上述的症状、体格检查和影像学检查来明确肛周脓肿是深还是浅。
