口腔扁平苔藓的发病与多种因素相关，包括免疫因素（免疫系统失衡致异常免疫攻击）、遗传因素（遗传易感性及多基因与环境相互作用）、感染因素（病毒、细菌感染可能参与）、内分泌因素（女性内分泌变化阶段病情波动）、精神神经因素（精神紧张等通过神经内分泌影响免疫功能）、微循环障碍因素（致口腔黏膜营养代谢失衡和免疫紊乱）以及其他因素（某些系统性疾病、不良生活方式等也与之相关）。
遗传因素
遗传易感性在口腔扁平苔藓的发病中具有一定作用。有研究表明，某些基因多态性与口腔扁平苔藓的易感性相关。例如，一些与免疫调节、细胞凋亡等相关的基因的突变或多态性可能增加个体患口腔扁平苔藓的风险。家族聚集性的病例报道也提示遗传因素可能参与其中，但具体的遗传模式较为复杂，不是单一基因的简单遗传，而是多基因与环境因素相互作用的结果。
感染因素
病毒感染：有研究推测病毒感染可能与口腔扁平苔藓的发病有关。例如，人类乳头瘤病毒（HPV）、丙型肝炎病毒（HCV）等的感染可能参与了口腔黏膜免疫状态的改变，进而诱发口腔扁平苔藓。但目前关于病毒感染与口腔扁平苔藓的确切关系还需要更多的研究来明确，只是发现了一些相关的关联迹象。
细菌感染：口腔中的一些细菌群落失衡也可能与口腔扁平苔藓的发病相关。例如，某些口腔致炎细菌的存在可能通过刺激宿主的免疫反应，导致口腔黏膜炎症的发生和持续，从而促进口腔扁平苔藓的发展。不过，细菌感染在口腔扁平苔藓发病中的具体机制还需进一步深入探究。
内分泌因素
内分泌紊乱可能与口腔扁平苔藓的发病有关。尤其在女性患者中，月经周期、妊娠、更年期等内分泌变化阶段，口腔扁平苔藓的病情可能会出现波动。例如，女性在更年期时，雌激素水平下降，可能影响口腔黏膜的免疫状态和代谢，从而增加口腔扁平苔藓的发病风险或导致病情加重。而男性患者也可能存在内分泌相关的调节异常，但相对女性来说，内分泌因素对男性口腔扁平苔藓发病的影响研究相对较少。
精神神经因素
精神紧张、焦虑、抑郁等精神神经因素与口腔扁平苔藓的发病也有一定关联。长期的精神压力可能通过神经内分泌系统影响机体的免疫功能，使免疫系统的平衡被打破，进而诱发或加重口腔扁平苔藓。例如，当患者处于长期精神紧张状态时，体内的应激激素分泌增加，可能干扰免疫细胞的功能，导致口腔黏膜的炎症反应加剧。
微循环障碍因素
口腔黏膜的微循环障碍可能参与口腔扁平苔藓的发病。微循环障碍会影响口腔黏膜组织的血液供应和营养物质的输送，同时也不利于代谢废物的排出，从而导致口腔黏膜组织的营养代谢失衡和免疫功能紊乱，促使口腔扁平苔藓的病损形成和发展。例如，微血管的痉挛、狭窄等情况可能导致口腔黏膜局部处于缺血缺氧状态，引发一系列的病理生理变化。
其他因素
某些系统性疾病：患有糖尿病、高血压等系统性疾病的患者，其口腔扁平苔藓的发病风险可能相对较高。这可能是因为这些系统性疾病会影响机体的整体健康状况和免疫功能，间接导致口腔黏膜出现病变。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体的免疫防御功能下降，容易受到各种病原体的侵袭，同时高血糖环境也有利于细菌等微生物的生长繁殖，从而增加口腔扁平苔藓的发病机会。
生活方式因素：长期吸烟、饮酒等不良生活方式也可能与口腔扁平苔藓的发病相关。吸烟产生的烟雾中含有多种有害物质，如尼古丁、焦油等，这些物质会对口腔黏膜造成直接的刺激和损伤，影响口腔黏膜的正常代谢和免疫功能。饮酒也可能通过类似的机制，或者通过影响机体的整体代谢和免疫状态，增加口腔扁平苔藓的发病风险。此外，过度劳累、缺乏锻炼等不良生活方式也可能降低机体的抵抗力，间接促进口腔扁平苔藓的发生。
