继发性乳糖不耐受恢复时间有较大个体差异，受原发病病情严重程度、个体年龄因素、生活方式因素、基础病史情况影响，轻度原发病、儿童、合理饮食、无基础病史者恢复相对快，重度原发病、成人、不良生活方式、有基础病史者恢复相对慢，一般数天到数周不等。
1.原发病的病情严重程度
轻度原发病：如果是由轻度的肠道感染等引起的继发性乳糖不耐受，原发病得到有效控制后，乳糖酶功能恢复相对较快，可能数天内就能逐渐恢复。例如，因轻度病毒性肠炎导致的继发性乳糖不耐受，随着肠炎症状缓解，肠道黏膜修复进程顺利，可能3-7天左右乳糖酶活性可逐步恢复，乳糖不耐受症状逐渐减轻。
重度原发病：若是由严重的肠道疾病，如重度炎症性肠病等引起的继发性乳糖不耐受，原发病的治疗周期长，肠道黏膜修复缓慢，乳糖酶恢复时间就会延长，可能需要数周甚至更长时间。因为重度原发病对肠道黏膜的损伤较严重，黏膜修复过程复杂且耗时，一般需要2-4周甚至更久才能使乳糖酶功能基本恢复正常。
2.个体的年龄因素
儿童群体：儿童的肠道黏膜修复能力相对较强，但不同年龄段也有差异。婴幼儿肠道发育尚不完善，若发生继发性乳糖不耐受，在原发病控制后，恢复时间相对儿童期稍短些，但也一般需要1-2周左右。而学龄期儿童肠道黏膜修复能力稍弱于婴幼儿，但如果原发病不严重，恢复时间可能在数天到2周左右。例如，婴幼儿因轮状病毒肠炎导致的继发性乳糖不耐受，若原发病较轻，可能5-10天左右恢复；学龄期儿童因轻度细菌性肠炎引起的继发性乳糖不耐受，可能7-14天恢复。
成人群体：成人肠道黏膜修复相对儿童稍慢，若成人发生继发性乳糖不耐受，原发病控制后，恢复时间可能稍长，一般在1-4周左右。但如果成人身体素质较好，原发病较轻，恢复时间可能缩短至1周左右；若身体素质较差或原发病较重，可能需要2-4周甚至更久。比如，年轻体健的成人因轻度食物中毒引起的继发性乳糖不耐受，原发病控制后，可能7-10天恢复；而老年成人因重度肠道感染导致的继发性乳糖不耐受，恢复时间可能延长至3-4周甚至更久，因为老年人肠道功能本身相对较弱，黏膜修复能力下降。
3.生活方式因素
合理饮食：在原发病治疗期间，注意合理调整饮食，避免摄入含乳糖的食物，给肠道足够的休息和修复时间，有助于继发性乳糖不耐受的恢复。例如，严格遵循无乳糖饮食，能让肠道黏膜减少乳糖的刺激，促进乳糖酶分泌功能的恢复，可使恢复时间缩短。反之，如果在原发病恢复期间仍大量摄入含乳糖的食物，会持续刺激受损的肠道黏膜，延缓乳糖酶的恢复，导致恢复时间延长。
良好作息：充足的睡眠和合理的作息有利于身体整体的恢复，包括肠道黏膜的修复。有良好作息的人，身体代谢和修复功能正常，继发性乳糖不耐受恢复相对较快。而长期熬夜、作息不规律的人，身体修复能力下降，可能会使继发性乳糖不耐受的恢复时间延长。比如，作息规律、睡眠充足的人发生继发性乳糖不耐受后，可能1-2周恢复；而长期熬夜、作息紊乱的人，可能需要2-3周甚至更久才能恢复。
4.基础病史情况
无基础病史人群：本身没有其他慢性肠道疾病等基础病史的人，发生继发性乳糖不耐受后，恢复相对顺利。因为身体整体状态良好，肠道功能正常，在原发病控制后，乳糖酶恢复时间较短，一般数天到2周左右即可恢复。
有基础病史人群：如果有慢性肠道疾病等基础病史，如既往有慢性结肠炎等，发生继发性乳糖不耐受时，肠道处于相对脆弱且修复能力较差的状态，恢复时间会延长。例如，既往有慢性结肠炎的患者发生继发性乳糖不耐受，原发病控制后，可能需要2-4周甚至更久才能使乳糖酶功能完全恢复，因为基础病史影响了肠道黏膜的正常修复进程。
