肾萎缩原因包括先天性肾发育不全、肾动脉狭窄、慢性肾小球肾炎、肾盂肾炎、高血压性肾损害；肾功能衰竭分急性和慢性，急性肾功能衰竭肾前性与血容量不足有关，肾性涉及肾小球疾病、肾小管间质疾病，肾后性由尿路梗阻引起，慢性肾功能衰竭有原发性肾脏疾病及糖尿病肾病、高血压肾损害、狼疮性肾炎等继发性肾脏疾病导致。
肾动脉狭窄：各种原因导致肾动脉主干或分支狭窄，使肾脏血液灌注不足，长期可引起肾实质萎缩。常见病因有动脉粥样硬化、纤维肌性发育不良等，中老年人动脉粥样硬化相对多见，年轻人纤维肌性发育不良更常见，动脉粥样硬化可能与高血脂、高血压等生活方式及基础疾病相关，高脂血症会使血管壁脂质沉积，逐渐导致动脉狭窄。
慢性肾小球肾炎：免疫介导的炎症持续损伤肾小球，随着病情进展，肾小球硬化、肾小管间质纤维化，肾脏逐渐萎缩。各年龄段均可发病，男性相对可能有一定易感性，发病可能与感染等诱发免疫反应有关，比如链球菌感染后未及时有效控制，引发自身免疫攻击肾小球。
肾盂肾炎：反复发作的慢性肾盂肾炎会破坏肾组织，导致肾间质纤维化、瘢痕形成，进而引起肾萎缩。女性由于尿道短等生理特点，更易患肾盂肾炎，急性肾盂肾炎若未彻底治愈，反复发作转为慢性容易出现这种情况，日常生活中不注意会阴清洁等也可能增加感染风险。
高血压性肾损害：长期高血压使肾小动脉管壁增厚、管腔狭窄，肾脏缺血，肾小球纤维化、肾小管萎缩，最终肾脏萎缩。高血压患者若血压控制不佳，长期处于高血压状态，就容易出现这种并发症，高血压的发生与高盐饮食、肥胖、缺乏运动等生活方式及遗传因素相关。
肾功能衰竭原因
急性肾功能衰竭
肾前性因素：血容量不足常见于大量失血、大量呕吐腹泻、大面积烧伤等情况，使肾脏灌注不足，肾小球滤过率下降。比如严重外伤导致大量失血，老年人由于体液调节功能相对较弱，血容量不足时更易影响肾功能，生活中过度脱水也可能引发这种情况。
肾性因素：
肾小球疾病：急进性肾小球肾炎等病情进展迅速，短时间内破坏大量肾小球，导致肾功能急剧恶化。各年龄段均可发病，发病机制与自身免疫反应攻击肾小球相关抗体等有关。
肾小管间质疾病：急性间质性肾炎多由药物过敏、感染等引起，药物如抗生素等可能引发过敏反应损伤肾小管间质，感染也可直接侵袭肾小管间质，儿童使用某些药物时需特别谨慎，因为儿童肝肾功能发育不完善，对药物的耐受和代谢能力与成人不同，更易因药物导致肾损伤出现急性肾功能衰竭。
肾后性因素：尿路梗阻，常见于尿路结石阻塞输尿管、尿道，前列腺增生导致膀胱出口梗阻等，使尿液排出受阻，肾盂内压力升高影响肾小球滤过和肾实质功能。老年人前列腺增生发病率较高，尿路结石可发生于任何年龄段，与代谢异常、尿路异物等多种因素有关。
慢性肾功能衰竭
原发性肾脏疾病：如慢性肾小球肾炎、IgA肾病等，病情缓慢进展，逐渐破坏肾组织，导致肾功能逐渐减退。不同年龄段均可能患病，IgA肾病在青少年中相对多见，与上呼吸道感染等诱因相关，感染后机体产生免疫反应损伤肾脏。
继发性肾脏疾病：
糖尿病肾病：糖尿病患者长期高血糖状态损伤肾小球微血管，引起肾小球硬化、肾功能下降。糖尿病发病率逐年上升，与高热量饮食、缺乏运动、肥胖等生活方式密切相关，病程较长的糖尿病患者更易出现糖尿病肾病，需要严格控制血糖、血压等延缓病情进展。
高血压肾损害：如前所述，长期高血压导致肾小动脉病变，肾脏缺血，逐渐发展为慢性肾功能衰竭，高血压患者需积极控制血压，将血压控制在合理范围，如一般主张高血压合并肾功能不全患者血压应控制在130/80mmHg以下，以延缓肾损害进展。
狼疮性肾炎：多见于育龄女性，是系统性红斑狼疮累及肾脏引起的免疫性损伤，自身免疫紊乱产生多种自身抗体攻击肾脏组织。女性由于自身免疫特性等因素相对易患，在疾病活动期需积极治疗控制免疫反应，避免肾功能进一步恶化。
