难免流产的发生与多种因素相关，包括染色体异常（胚胎染色体数目或结构异常，孕妇年龄增加会使胚胎染色体异常概率升高，父亲精子染色体异常也可致胚胎异常）、母体因素（全身性疾病、生殖器官异常、内分泌异常、免疫功能异常等，如全身性疾病中严重感染、贫血等，生殖器官异常中的子宫畸形、宫腔粘连等，内分泌异常中的黄体功能不全、甲状腺功能异常、糖尿病等，免疫功能异常中的自身免疫性疾病、同种免疫异常等）、环境因素（接触化学物质如苯等、物理因素如放射线、高温等）。
年龄因素影响：年龄是一个重要的影响因素，女性随着年龄增长，卵子质量下降，染色体发生畸变的概率增加，从而导致难免流产的风险上升。
母体因素
全身性疾病：孕妇患有严重的全身性疾病，如严重感染（如败血症等）、高热可使子宫收缩导致流产；严重贫血或心力衰竭可致胎儿缺氧死亡；慢性肾炎、高血压等可使胎盘发生梗死或早剥而引起流产。这些疾病对不同年龄、不同生活方式的孕妇都可能产生影响，例如长期有高血压病史且血压控制不佳的孕妇，发生难免流产的风险相对较高。
生殖器官异常：
子宫畸形：如子宫纵隔、单角子宫、双角子宫等，子宫的形态异常会影响胚胎的着床和发育。例如子宫纵隔会使宫腔内环境异常，胚胎种植受到影响，从而增加难免流产的发生风险。这种情况在有先天性子宫发育异常病史的孕妇中较为常见。
宫腔粘连：多由于宫腔操作（如人工流产、清宫术等）损伤子宫内膜引起，宫腔粘连会导致宫腔容积减小，影响胚胎的生长空间，进而增加难免流产的可能性。有过多次宫腔操作史的孕妇发生宫腔粘连从而导致难免流产的风险较高。
内分泌异常：
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对于维持妊娠至关重要。黄体功能不全时，孕酮分泌不足，不能支持胚胎的发育，可导致流产。据研究，黄体功能不全引起的流产约占早期流产的15%-20%。这种情况在有内分泌疾病病史（如多囊卵巢综合征等）的孕妇中较为常见，不同年龄的孕妇都可能出现，尤其是患有多囊卵巢综合征的育龄女性。
甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进都可能影响妊娠。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响胚胎的生长发育；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰妊娠过程。有甲状腺疾病病史的孕妇发生难免流产的风险增加，比如既往诊断为甲状腺功能减退且未规范治疗的孕妇。
糖尿病：未控制好血糖的糖尿病孕妇，高血糖环境会影响胚胎的发育，增加流产的风险。尤其是患有1型糖尿病且血糖长期控制不佳的孕妇，发生难免流产的概率相对较高。
免疫功能异常：
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等，孕妇体内存在自身抗体，可攻击胎盘组织，影响胎盘的血液循环，导致胚胎流产。患有自身免疫性疾病的孕妇，无论年龄大小，都需要密切关注妊娠情况，因为自身抗体的存在会持续对妊娠造成不良影响。
同种免疫异常：孕妇与胎儿之间的免疫不适应，母体免疫系统对胚胎产生排斥反应。例如母胎免疫识别异常等情况，可能导致难免流产的发生。这种情况在一些有复发性流产病史且经检查发现存在同种免疫异常的孕妇中较为常见。
父亲因素
精子染色体异常：父亲的精子染色体异常也可能导致胚胎染色体异常，从而增加难免流产的风险。随着男性年龄的增加，精子染色体异常的概率也会升高，比如40岁以上男性的精子染色体异常率高于年轻男性。长期接触有害环境因素（如辐射、化学毒物等）的男性，其精子质量下降，染色体异常的概率增加，也会影响胚胎的正常发育，增加难免流产的可能性。
环境因素
化学物质接触：孕妇接触过多的有害化学物质，如苯、甲醛、农药等，这些化学物质可通过胎盘影响胚胎发育，导致难免流产。例如长期在含有苯的环境中工作的孕妇，接触苯后可能会引起胚胎毒性，增加流产风险。不同生活方式的孕妇，如果长期处于有化学物质污染的环境中，如新装修且未充分通风的房屋中居住较长时间，就会增加接触有害化学物质的机会，进而影响妊娠。
物理因素：过多接触放射线，如孕妇在不知情的情况下接受了X线检查等，放射线可导致胚胎染色体畸变，引起流产。长期处于高温环境（如长时间泡温泉、高温工作环境等）也可能影响胚胎的发育，增加难免流产的风险。例如一些从事高温作业的孕妇，其工作环境的高温可能对胚胎产生不良影响。
