萎缩性胃炎的发病受多种因素影响，幽门螺杆菌感染是最主要病因，饮食习惯方面长期高盐、酗酒、食用辛辣刺激性食物会损伤胃黏膜，自身免疫因素可致自身免疫性萎缩性胃炎，遗传因素使携带易感基因者更易发病，年龄增长、长期服用某些药物等也与之相关，老年人及有相关家族史等人群风险更高。
饮食习惯
长期高盐饮食：高盐饮食会损伤胃黏膜的屏障功能。高浓度的盐会直接刺激胃黏膜，使胃黏膜发生充血、水肿等炎症改变，长期如此，胃黏膜的正常结构和功能遭到破坏，容易引发萎缩性胃炎。有研究表明，长期每日盐摄入量超过6克的人群，患萎缩性胃炎的风险比低盐饮食人群高出一定比例。不同年龄阶段人群对高盐饮食的耐受和损伤反应有所不同，一般来说，成年人长期高盐饮食更易累积损伤，但儿童若长期摄入高盐食物，也会对尚未发育完善的胃黏膜造成不良影响。
长期酗酒：酒精中的乙醇会直接损伤胃黏膜上皮细胞，引起黏膜充血、水肿、糜烂等，还会影响胃黏膜的血液循环和黏液分泌功能。长期酗酒者胃黏膜持续受到酒精的刺激，导致胃黏膜反复炎症损伤，进而发展为萎缩性胃炎。男性相对女性可能因饮酒习惯等因素，更容易因酗酒引发萎缩性胃炎，但女性长期酗酒同样会面临较高风险。对于不同年龄人群，青少年饮酒对胃黏膜的损伤更为严重，因为其胃黏膜处于发育阶段，更脆弱；成年人长期酗酒则会逐渐积累损伤。
长期食用辛辣刺激性食物：辛辣刺激性食物会刺激胃黏膜，导致胃黏膜反复处于应激状态，引起胃黏膜的慢性炎症。例如辣椒中的辣椒素等成分会刺激胃黏膜，使胃黏膜充血，长期大量食用会增加患萎缩性胃炎的可能性。不同年龄人群对辛辣刺激性食物的耐受程度不同，年轻人可能更偏好此类食物，但长期食用对胃黏膜的损伤是共性的，儿童若摄入辛辣刺激性食物也会影响胃黏膜健康。
自身免疫因素
自身免疫性萎缩性胃炎多见于自身免疫功能紊乱的人群。患者体内产生针对胃壁细胞或内因子的自身抗体，攻击胃黏膜壁细胞，导致壁细胞数量减少，胃酸分泌减少，同时内因子缺乏影响维生素B的吸收，进而引起恶性贫血等一系列表现。自身免疫因素导致的萎缩性胃炎在不同性别上可能有一定差异，女性相对男性可能更容易出现自身免疫功能紊乱相关的疾病，但具体机制仍与自身免疫的异常反应有关。任何年龄都可能发生自身免疫性萎缩性胃炎，但在一些自身免疫性疾病高发的年龄段或有自身免疫疾病家族史的人群中风险相对较高。比如有自身免疫性甲状腺疾病家族史的人群，同时发生自身免疫性萎缩性胃炎的概率可能会增加。
遗传因素
遗传因素在萎缩性胃炎的发病中也起到一定作用。某些遗传易感基因的存在会使个体更容易受到上述各种致病因素的影响而发生胃黏膜萎缩。例如，某些特定基因的多态性与幽门螺杆菌感染的易感性、胃黏膜的修复能力等相关，携带这些易感基因的人群在相同的外界致病因素作用下，更易发展为萎缩性胃炎。不同遗传背景的人群发病风险不同，有家族遗传倾向的人群需要更加关注自身胃黏膜健康，定期进行相关检查。在儿童中，如果家族中有萎缩性胃炎的遗传病史，那么儿童可能在成长过程中因遗传易感性而面临更高的发病风险，需要在饮食、生活习惯等方面更加注意预防。
其他因素
年龄因素：随着年龄的增长，胃黏膜也会出现生理性萎缩，这是一种随着年龄增加而发生的退行性改变，但病理性萎缩性胃炎在老年人中更为常见。老年人胃黏膜的屏障功能减退，对各种致病因素的抵御能力下降，更容易受到幽门螺杆菌感染、不良饮食习惯等因素的影响而发展为萎缩性胃炎。一般50岁以上人群患萎缩性胃炎的概率明显高于年轻人。
长期服用某些药物：长期服用非甾体类抗炎药（如阿司匹林等）、某些抗生素等药物可能会损伤胃黏膜。非甾体类抗炎药会抑制环氧合酶的活性，减少前列腺素的合成，从而削弱胃黏膜的保护机制；某些抗生素也可能对胃黏膜造成直接或间接的损伤，长期服用这类药物的人群患萎缩性胃炎的风险增加。不同年龄人群服用相关药物后发生胃黏膜损伤的情况不同，老年人由于肝肾功能相对减退，药物代谢能力下降，服用药物后更易在体内蓄积，对胃黏膜的损伤可能更明显；儿童则应尽量避免使用可能损伤胃黏膜的药物，除非在医生严格评估利弊后确实需要使用。
