肉眼血尿可由多种原因引起，包括泌尿系统疾病（如肾小球疾病的急性肾小球肾炎、IgA肾病，尿路感染，泌尿系统结石的肾结石、输尿管结石、膀胱结石，泌尿系统肿瘤的肾癌、膀胱癌、肾盂癌）、全身性疾病（如血液病的血小板减少性紫癜、白血病，感染性疾病的流行性出血热、感染性心内膜炎）以及其他因素（如药物副作用、剧烈运动、外伤）。
一、泌尿系统疾病
1.肾小球疾病
急性肾小球肾炎：多见于儿童及青少年，常因β-溶血性链球菌感染后引起免疫反应，导致肾小球滤过膜损伤，出现肉眼血尿，同时可伴有蛋白尿、水肿、高血压等表现。例如相关研究表明，急性链球菌感染后肾小球肾炎患者中约40%-70%会出现肉眼血尿。
IgA肾病：是最常见的原发性肾小球肾炎，好发于青少年，男性多于女性，多在上呼吸道感染（如扁桃体炎等）后数小时至3天内出现发作性肉眼血尿，可伴有蛋白尿等。大量研究显示，IgA肾病患者中约40%-50%以肉眼血尿为首发症状。
2.尿路感染
无论是上尿路感染（肾盂肾炎）还是下尿路感染（膀胱炎、尿道炎）都可能导致肉眼血尿，女性由于尿道短等生理特点更容易发生尿路感染。细菌感染引起尿路黏膜充血、水肿、糜烂等，从而出现肉眼血尿，常伴有尿频、尿急、尿痛等尿路刺激症状。例如临床统计显示，急性膀胱炎患者中约有10%-15%可出现肉眼血尿。
3.泌尿系统结石
肾结石：可发生于任何年龄，男性多于女性，结石在泌尿系统内移动时，会损伤尿路黏膜，引起肉眼血尿，疼痛是其另一主要症状，疼痛性质多为肾绞痛，可向会阴部放射。研究发现，肾结石患者中约80%会出现血尿，其中肉眼血尿占一定比例。
输尿管结石：多由肾结石下移而来，可引起输尿管梗阻，导致输尿管黏膜损伤出血，出现肉眼血尿，同时伴有剧烈的肾绞痛，疼痛沿输尿管走行放射。
膀胱结石：多见于儿童，也可见于老年人，主要症状为排尿困难、血尿和膀胱刺激症状，排尿过程中结石移动刺激膀胱黏膜导致出血，出现肉眼血尿。
4.泌尿系统肿瘤
肾癌：多见于50-70岁男性，典型表现为无痛性肉眼血尿、腰痛和腹部肿块，血尿常为间歇性发作，肿瘤侵犯肾盂、肾盏时可引起血尿。临床资料表明，约70%的肾癌患者会出现肉眼血尿。
膀胱癌：是泌尿系统最常见的肿瘤，多见于50岁以上男性，主要症状为无痛性肉眼血尿，可呈间歇性或持续性发作，出血量多少不等。研究显示，约85%的膀胱癌患者以肉眼血尿为首发症状。
肾盂癌：也可出现无痛性肉眼血尿，常伴有条索状血块，肿瘤细胞脱落可随尿液移动，刺激肾盂、输尿管黏膜引起出血。
二、全身性疾病
1.血液病
血小板减少性紫癜：由于血小板数量减少或功能异常，导致凝血功能障碍，可出现皮肤黏膜出血，也可累及泌尿系统，引起肉眼血尿。儿童及成人均可发病，女性患者可能与月经等因素有关，血小板计数明显降低是其重要特征。
白血病：白血病患者骨髓造血功能异常，血小板生成减少，同时白血病细胞可浸润血管，导致出血倾向，可出现肉眼血尿，常伴有贫血、发热、肝脾淋巴结肿大等表现。例如急性白血病患者中约有部分会出现泌尿系统出血表现，包括肉眼血尿。
2.感染性疾病
流行性出血热：由汉坦病毒引起，可累及泌尿系统，导致肾小球及肾小血管损伤，出现肉眼血尿，同时伴有发热、出血、肾损害等表现，多见于流行地区的人群，有明确的流行病学史。
感染性心内膜炎：细菌等病原体感染心内膜，形成赘生物，赘生物脱落的栓子可能栓塞泌尿系统血管，导致出血，出现肉眼血尿，同时伴有发热、心脏杂音、皮肤瘀点等表现。
三、其他因素
1.药物副作用
某些药物可导致泌尿系统损伤，引起肉眼血尿，如环磷酰胺等化疗药物，可引起出血性膀胱炎，导致膀胱黏膜损伤出血，出现肉眼血尿。长期服用抗凝剂如华法林等，也可能因凝血功能异常导致泌尿系统出血。
2.剧烈运动
剧烈运动后可出现运动性血尿，多见于长跑、登山等运动后，可能是由于肾脏受到震动、肾脏缺血等原因导致肾小球滤过膜通透性增加，出现肉眼血尿，一般休息后可逐渐缓解。青少年在进行剧烈运动时更易发生这种情况，应注意运动强度和适度休息。
3.外伤
泌尿系统受到外伤，如肾挫伤、膀胱破裂等，可导致泌尿系统组织损伤出血，出现肉眼血尿，有明确的外伤史，同时可伴有局部疼痛、肿胀等表现。例如交通事故、高处坠落等导致的泌尿系统外伤，都可能引起肉眼血尿。
