慢性肠炎的发生与感染因素、肠道菌群失调、自身免疫因素相关。感染因素中细菌感染受年龄、性别、生活方式、病史影响，常见沙门氏菌、志贺氏菌等；病毒感染婴幼儿易患，与生活方式、病史有关，轮状病毒、诺如病毒常见；肠道菌群失调受年龄、生活方式、病史影响，不合理饮食、长期用广谱抗生素等易致；自身免疫因素有性别、年龄差异，生活方式、病史也有影响，自身免疫异常可致如克罗恩病等自身免疫性慢性肠炎。
一、感染因素
（一）细菌感染
1.年龄与性别影响：不同年龄段和性别对细菌感染的易感性有所不同。例如，儿童由于免疫系统发育尚未完善，相对更容易受到细菌感染引发慢性肠炎。在性别方面，一般无明显差异，但女性在生理期等特殊时期，身体抵抗力可能会有波动，也可能增加细菌感染风险。
2.生活方式关联：不良生活方式是重要诱因。如饮食不卫生，食用被细菌污染的食物，像变质的肉类、被污染的蔬菜水果等。长期饮酒、吸烟等不良习惯会削弱肠道黏膜的屏障功能，使肠道更容易受到细菌侵袭。有旅行史的人群，到卫生条件较差地区时，接触当地受污染水源或食物，也易感染细菌引发慢性肠炎。
3.病史影响：既往有肠道手术史、肠道基础疾病史等人群，肠道正常结构和功能受到影响，肠道菌群平衡易被打破，细菌更容易定植和繁殖，从而引发慢性肠炎。例如，曾患过溃疡性结肠炎的患者，肠道黏膜处于受损状态，后续发生细菌感染导致慢性肠炎的几率增加。
常见的引起慢性肠炎的细菌有沙门氏菌、志贺氏菌等。沙门氏菌常污染肉类、蛋类等食物，人食用后可引起肠道炎症反应，若感染未得到彻底控制，就可能发展为慢性肠炎。志贺氏菌感染主要通过粪-口途径传播，可导致肠道黏膜的炎症、溃疡等，进而转为慢性。
（二）病毒感染
1.年龄性别因素：儿童尤其是婴幼儿，由于免疫系统发育不成熟，对病毒感染的抵御能力较弱，更容易因病毒感染引发慢性肠炎。不同性别在病毒感染引发慢性肠炎的几率上无显著差异，但婴幼儿群体整体更易受影响。
2.生活方式因素：生活中接触病毒的机会较多，如在人员密集且通风不良的场所，容易接触到如轮状病毒等。不良卫生习惯，如饭前便后不洗手，增加了病毒经口进入肠道的风险。此外，过度劳累、长期精神紧张等不良生活方式会影响机体免疫力，使病毒更易在肠道内持续感染，引发慢性肠炎。
3.病史因素：既往有免疫缺陷病史的人群，如艾滋病患者，由于自身免疫功能严重受损，对病毒的清除能力下降，更容易发生病毒持续性感染肠道，导致慢性肠炎。
轮状病毒是引起婴幼儿慢性肠炎较常见的病毒之一，主要通过消化道传播，可在婴幼儿群体中引起长期的肠道炎症反应。诺如病毒也是常见的引起肠道感染的病毒，能导致人出现呕吐、腹泻等症状，若感染后未完全恢复，也可能转为慢性肠炎。
二、肠道菌群失调
1.年龄影响：婴幼儿肠道菌群尚处于建立和完善阶段，容易出现菌群失调。老年人随着年龄增长，肠道菌群的多样性和稳定性下降，也更易发生菌群失调。例如，婴幼儿肠道菌群受喂养方式影响较大，母乳喂养儿和人工喂养儿肠道菌群组成有差异，人工喂养儿肠道菌群失调引发慢性肠炎的风险相对可能更高一些。
2.生活方式影响：不合理的饮食是重要因素，长期食用高脂肪、高糖、低纤维食物，会改变肠道内环境，影响有益菌的生长，导致有害菌相对增多，引起菌群失调。长期使用广谱抗生素，会破坏肠道正常菌群平衡，因为抗生素在杀灭致病菌的同时，也会无差别地杀灭有益菌，使得肠道菌群失调，增加慢性肠炎发生风险。
3.病史影响：患有肠道疾病如炎症性肠病、肠道肿瘤等疾病的患者，肠道微环境发生改变，容易出现菌群失调。此外，长期服用某些特定药物，如质子泵抑制剂等，也可能影响肠道菌群，进而引发慢性肠炎。例如，炎症性肠病患者肠道黏膜处于炎症状态，局部免疫环境改变，导致肠道菌群失调，而菌群失调又会进一步加重肠道炎症，形成恶性循环。
三、自身免疫因素
1.性别因素：某些自身免疫性慢性肠炎疾病在性别上有一定差异。例如，溃疡性结肠炎女性发病率相对略高于男性。可能与女性的激素水平等因素有关，女性体内雌激素等激素水平的波动可能影响自身免疫调节机制，使得女性更易发生自身免疫相关的肠道炎症反应。
2.年龄因素：自身免疫性慢性肠炎在不同年龄段均可发病，但一些自身免疫性肠道疾病在特定年龄段更易出现。比如，青少年时期可能是某些自身免疫性肠道疾病的发病高峰期。年龄相关的免疫系统发育、衰老等因素影响自身免疫功能，从而导致肠道自身免疫性炎症的发生。
3.生活方式与病史因素：长期精神压力过大等不良生活方式可能影响自身免疫调节。有自身免疫性疾病家族史的人群，自身免疫相关基因易感性增加，发生自身免疫性慢性肠炎的风险更高。例如，若家族中有类风湿关节炎等自身免疫性疾病患者，其亲属发生自身免疫性慢性肠炎的几率可能高于无家族史人群。自身免疫性慢性肠炎如克罗恩病，其发病机制与自身免疫异常密切相关，肠道局部免疫系统异常激活，攻击肠道自身组织，导致肠道慢性炎症、溃疡等病变，进而发展为慢性肠炎。
