慢性腹泻的原因包括肠道疾病相关、全身性疾病相关及药物相关。肠道疾病相关有感染性因素（细菌、病毒、寄生虫感染）和非感染性肠道疾病（炎症性肠病、肠易激综合征、吸收不良综合征）；全身性疾病相关有内分泌及代谢性疾病（甲状腺功能亢进症、糖尿病）和其他全身性疾病（肝胆疾病、尿毒症）；药物使用也可能引发慢性腹泻。
一、肠道疾病相关原因
（一）感染性因素
1.细菌感染：如大肠杆菌、沙门氏菌等感染肠道后，会引起肠道炎症反应，导致肠道黏膜受损，影响肠道的正常吸收和分泌功能，从而引发慢性腹泻。例如，一些人食用了被污染的食物后，可能会感染相关细菌，出现长期腹泻的症状。对于儿童来说，由于免疫系统相对较弱，更容易受到细菌感染引发慢性腹泻。
2.病毒感染：轮状病毒、诺如病毒等病毒感染肠道后，会在肠道内大量复制，破坏肠道细胞，影响肠道的消化和吸收功能。病毒感染引起的慢性腹泻在儿童群体中较为常见，比如轮状病毒感染常导致婴幼儿出现较长时间的腹泻。
3.寄生虫感染：如阿米巴原虫、贾第虫等寄生虫感染肠道，会在肠道内寄生并繁殖，刺激肠道黏膜，导致肠道功能紊乱，引起慢性腹泻。例如，在一些卫生条件较差的地区，人群感染寄生虫导致慢性腹泻的情况时有发生。
（二）非感染性肠道疾病
1.炎症性肠病
克罗恩病：病因尚不明确，可能与遗传、免疫等因素有关。病变可累及肠道全层，导致肠道黏膜炎症、溃疡等，引起慢性腹泻，常伴有腹痛、体重下降等症状。这种疾病可发生在任何年龄，但青少年和年轻成年人相对多见。
溃疡性结肠炎：主要累及直肠和结肠黏膜，表现为肠道黏膜的慢性炎症、溃疡和糜烂，导致慢性腹泻，多伴有黏液脓血便、腹痛等症状。其发病年龄多在15-30岁和50-70岁两个年龄段。
2.肠易激综合征：是一种常见的功能性肠道疾病，与胃肠动力异常、肠道菌群失调、精神心理因素等有关。患者主要表现为慢性腹泻型，伴有腹痛、腹胀，症状可在排便后缓解，情绪紧张或压力过大等精神因素常可诱发或加重病情。各年龄段均可发病，女性相对多见。
3.吸收不良综合征：多种原因引起的肠道吸收功能障碍，导致营养物质不能正常吸收，引起慢性腹泻。例如，乳糖不耐受患者由于体内缺乏乳糖酶，不能正常消化乳糖，食用含乳糖的食物后会出现腹泻等症状；短肠综合征患者由于肠道吸收面积减少，也会出现慢性腹泻。
二、全身性疾病相关原因
（一）内分泌及代谢性疾病
1.甲状腺功能亢进症：甲状腺激素分泌过多，会加速机体的新陈代谢，影响肠道的消化和吸收功能，导致胃肠蠕动加快，引起慢性腹泻。患者还常伴有多汗、心慌、消瘦等症状，多见于中青年女性。
2.糖尿病：糖尿病患者如果血糖控制不佳，可能会出现自主神经病变，影响肠道的神经调节功能，导致肠道运动和分泌功能紊乱，引起慢性腹泻。此外，高血糖环境也有利于肠道细菌的生长繁殖，进一步加重腹泻。各年龄段糖尿病患者均可能发生，尤其以病程较长的患者多见。
（二）其他全身性疾病
1.肝胆疾病：如慢性肝炎、肝硬化等，会影响胆汁的分泌和排泄，导致脂肪消化吸收不良，引起脂肪泻，表现为慢性腹泻，粪便常呈灰白色、油腻状。这类患者多有肝脏疾病的病史，如长期饮酒、慢性病毒性肝炎等。
2.尿毒症：慢性肾衰竭患者发展到尿毒症阶段，由于体内代谢废物不能正常排出，会影响胃肠道功能，出现慢性腹泻等消化道症状。同时，患者还会伴有恶心、呕吐、水肿等其他尿毒症相关表现。
三、药物相关原因
某些药物的使用可能会引起慢性腹泻的不良反应。例如，一些抗生素的长期使用可能会导致肠道菌群失调，引起腹泻；化疗药物在杀伤肿瘤细胞的同时，也可能会损伤肠道黏膜，导致慢性腹泻等胃肠道反应。不同药物引起腹泻的机制不同，在使用这些药物的过程中需要密切观察患者的肠道反应。
