婴儿运动发育迟缓的原因包括先天性因素（遗传致染色体异常或单基因神经肌肉病、胚胎发育受外界不良因素或自身程序问题影响）、出生时及新生儿期因素（早产使器官系统尤其是神经发育不成熟且易并发并发症、出生窒息致脑部缺氧缺血损伤神经）、后天环境及疾病因素（营养缺乏如蛋白-能量或维生素缺乏影响、中枢神经、神经肌肉、内分泌等疾病影响、缺乏适当运动刺激）。
一、先天性因素
1.遗传因素
某些遗传性疾病会导致婴儿运动发育迟缓。例如，染色体异常疾病，如21-三体综合征（唐氏综合征），患儿存在特定的染色体畸变，会影响神经系统的正常发育，从而导致运动发育落后于正常婴儿。研究表明，21-三体综合征患儿的运动功能发育明显迟缓，在大运动如抬头、坐、站、走等方面均晚于正常儿童。
一些单基因遗传性神经肌肉疾病也可引起运动发育迟缓，如脊髓性肌萎缩症，这是由于运动神经元存活基因1（SMN1）突变导致脊髓前角运动神经元变性，影响肌肉的神经支配，使婴儿肌肉力量减弱，运动发育滞后。
2.胚胎发育异常
在胚胎发育早期，如果受到外界不良因素影响或自身发育程序出现问题，可能导致中枢神经系统发育异常。比如孕妇在妊娠早期感染风疹病毒，病毒可通过胎盘影响胎儿神经系统发育，使婴儿出生后运动发育迟缓。有研究显示，孕期感染风疹病毒的胎儿，出生后在运动功能方面明显落后于未感染的胎儿，表现为抬头、翻身等大运动出现时间延迟。
二、出生时及新生儿期因素
1.早产
早产儿由于胎龄小，各器官系统尤其是神经系统发育不成熟。早产儿的大脑皮质发育不完善，神经突触形成不足，影响运动功能的发育。一般来说，胎龄越小，出生体重越低的早产儿，运动发育迟缓的发生率越高。例如，胎龄小于32周的早产儿，在1岁时大运动发育达到正常婴儿水平的比例明显低于足月儿。
早产儿在出生后可能面临多种并发症，如脑室周围-脑室内出血、脑白质软化等，这些并发症会进一步损伤神经系统，导致运动发育迟缓。有研究发现，早产儿发生脑室周围-脑室内出血后，运动发育迟缓的风险比无出血的早产儿增加数倍。
2.出生窒息
胎儿在宫内或分娩过程中发生窒息，会导致脑部缺氧缺血，引起脑损伤。缺氧缺血性脑病可影响运动相关的神经传导通路和神经中枢的发育，从而导致婴儿运动发育迟缓。出生窒息的程度越严重，运动发育迟缓的可能性越大。重度窒息的婴儿，在出生后数月甚至数年仍可能存在运动功能障碍，如不能正常抬头、坐立等。
三、后天环境及疾病因素
1.营养因素
婴儿期是生长发育的关键时期，营养物质的缺乏会影响运动发育。例如，蛋白质-能量营养不良，会导致婴儿身体发育迟缓，包括运动功能发育迟缓。因为蛋白质是神经细胞发育的重要物质基础，能量不足会影响身体的整体发育，进而影响运动功能的发展。研究表明，长期营养不良的婴儿，其大运动和精细运动的发育均落后于营养良好的婴儿。
维生素缺乏也会影响运动发育，如维生素D缺乏性佝偻病，维生素D缺乏会影响钙磷代谢，导致骨骼发育异常，而骨骼的正常发育对于婴儿的运动功能如站立、行走等是基础，所以维生素D缺乏性佝偻病患儿可能出现运动发育迟缓，表现为坐、站、走等大运动出现时间延迟。
2.疾病因素
中枢神经系统疾病：如脑炎、脑膜炎等感染性疾病，炎症可损伤中枢神经系统，影响运动相关的神经调控。例如，婴儿患化脓性脑膜炎后，炎症累及脑实质，会导致运动功能障碍，出现运动发育迟缓。有临床数据显示，约30%-50%的化脓性脑膜炎患儿在急性期后会出现不同程度的运动发育迟缓。
神经肌肉疾病：如进行性肌营养不良症，这是一组遗传性肌肉变性疾病，主要影响肌肉的正常功能，导致肌肉无力，进而影响婴儿的运动发育，表现为肌肉无力、运动发育落后，如抬头困难、行走延迟等。
内分泌疾病：甲状腺功能减退症患儿由于甲状腺激素分泌不足，会影响身体的生长发育和神经系统发育，导致运动发育迟缓。甲状腺激素对神经系统的发育和功能维持至关重要，甲状腺功能减退的婴儿会出现运动发育落后于同龄儿，如坐、站、走等大运动明显延迟。
3.缺乏适当的运动刺激
婴儿在成长过程中需要适当的运动刺激来促进运动功能的发育。如果婴儿被过度保护，长期处于缺乏活动空间或缺乏家长引导进行运动练习的环境中，会导致运动发育迟缓。例如，家长总是将婴儿长时间放在婴儿车里，很少让婴儿进行翻身、爬行等运动练习，婴儿的大运动发育就会受到影响，出现抬头晚、坐立晚等情况。
